42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2116 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2116  hypothetical protein  100 
 
 		 1132 aa  2261    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159421  normal  0.0275149 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1887  hypothetical protein  44.27 
 
 		 1141 aa  994    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1909  hypothetical protein  92.59 
 
 		 1133 aa  2097    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.277699 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1474  hypothetical protein  45.51 
 
 		 1128 aa  978    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.105081  normal  0.0154551 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2261  hypothetical protein  34.19 
 
 		 1132 aa  587  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0919  hypothetical protein  33.28 
 
 		 1146 aa  578  1.0000000000000001e-163  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0925  hypothetical protein  33.19 
 
 		 1146 aa  575  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1786  hypothetical protein  31.24 
 
 		 1111 aa  523  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.666865  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4196  hypothetical protein  25.39 
 
 		 1177 aa  254  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.61933  normal  0.838323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6053  hypothetical protein  28.3 
 
 		 1192 aa  249  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796735  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2449  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1243 aa  244  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.276493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2847  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1237 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3957  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1232 aa  240  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2735  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1240 aa  235  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.37648  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1669  hypothetical protein  26.78 
 
 		 1210 aa  233  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2333  hypothetical protein  28.01 
 
 		 1255 aa  232  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5848  hypothetical protein  28.04 
 
 		 1141 aa  231  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0691435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3001  hypothetical protein  26.52 
 
 		 1244 aa  229  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.11101 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1618  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1197 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115001 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3211  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1151 aa  212  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595014  normal  0.501741 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1807  hypothetical protein  27.4 
 
 		 1149 aa  210  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00797206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3169  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1149 aa  209  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0013  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1240 aa  201  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2985  hypothetical protein  25 
 
 		 1175 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109537  normal  0.516581 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3269  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1169 aa  189  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.723226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2972  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1094 aa  127  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1618  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1094 aa  125  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0243061 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1851  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1097 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.972966 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1307  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1162 aa  112  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.684486  normal  0.422338 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1092  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1155 aa  103  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1716  hypothetical protein  23.82 
 
 		 1093 aa  100  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.513368 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2037  hypothetical protein  21.69 
 
 		 1088 aa  99.8  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.86999  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2948  hypothetical protein  32.73 
 
 		 1102 aa  75.1  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.323193 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0760  hypothetical protein  21.2 
 
 		 996 aa  72.4  0.00000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0181  hypothetical protein  26.36 
 
 		 943 aa  65.9  0.000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0264  hypothetical protein  23.1 
 
 		 995 aa  62.8  0.00000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0149  hypothetical protein  34.52 
 
 		 1024 aa  60.1  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0731967  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0305  hypothetical protein  22.68 
 
 		 1040 aa  57.4  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.396383  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  26.45 
 
 		 1094 aa  46.2  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  22.95 
 
 		 1061 aa  45.1  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4440  protein of unknown function DUF490  24.29 
 
 		 1981 aa  44.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  24.04 
 
 		 1061 aa  44.7  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>