49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3269 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3269  hypothetical protein  100 
 
 		 1169 aa  2315    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.723226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2037  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1088 aa  295  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.86999  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2449  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1243 aa  249  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.276493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0013  hypothetical protein  25.3 
 
 		 1240 aa  249  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2735  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1240 aa  234  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.37648  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3001  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1244 aa  232  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.11101 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1618  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1197 aa  228  5.0000000000000005e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2847  hypothetical protein  23.66 
 
 		 1237 aa  226  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1669  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1210 aa  218  7e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2333  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1255 aa  216  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1887  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1141 aa  213  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3211  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1151 aa  210  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595014  normal  0.501741 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1474  hypothetical protein  25.77 
 
 		 1128 aa  210  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.105081  normal  0.0154551 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4196  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1177 aa  209  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.61933  normal  0.838323 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1786  hypothetical protein  25.33 
 
 		 1111 aa  207  8e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.666865  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1092  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1155 aa  206  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2985  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1175 aa  206  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109537  normal  0.516581 
 
 
-
 
NC_004310  BR0925  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1146 aa  206  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0919  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1146 aa  206  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2261  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1132 aa  201  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6053  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1192 aa  201  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796735  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3169  hypothetical protein  23.8 
 
 		 1149 aa  198  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5848  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1141 aa  195  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0691435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3957  hypothetical protein  22.82 
 
 		 1232 aa  194  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1807  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1149 aa  193  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00797206 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1307  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1162 aa  189  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.684486  normal  0.422338 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1179  hypothetical protein  24.33 
 
 		 1105 aa  184  6e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00453923  normal  0.431932 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2116  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1132 aa  181  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159421  normal  0.0275149 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1909  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1133 aa  181  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.277699 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1618  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1094 aa  170  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0243061 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1851  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1097 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.972966 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2948  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1102 aa  166  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.323193 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1716  hypothetical protein  24.05 
 
 		 1093 aa  162  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.513368 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0264  hypothetical protein  30.58 
 
 		 995 aa  148  6e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0760  hypothetical protein  31.62 
 
 		 996 aa  139  2e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0149  hypothetical protein  40.78 
 
 		 1024 aa  127  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0731967  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0305  hypothetical protein  30.32 
 
 		 1040 aa  108  9e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.396383  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0181  hypothetical protein  31.38 
 
 		 943 aa  107  2e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2972  hypothetical protein  32.82 
 
 		 1094 aa  95.9  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1861  membrane protein-like protein  25.93 
 
 		 1144 aa  68.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.777283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3774  membrane protein-like  25 
 
 		 1234 aa  59.7  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0394533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0705  membrane protein-like protein  28.28 
 
 		 1224 aa  50.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113545  hitchhiker  0.00000969857 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0763  AsmA family protein  24.32 
 
 		 1070 aa  51.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116181  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  23.19 
 
 		 1094 aa  50.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0549  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1210 aa  46.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1341 aa  46.2  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  20.65 
 
 		 1079 aa  46.2  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1371  AsmA family protein  24.14 
 
 		 1104 aa  45.8  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000870938  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  21.95 
 
 		 1080 aa  44.7  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>