46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2735 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3957  hypothetical protein  62.68 
 
 		 1232 aa  1521    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4196  hypothetical protein  35.49 
 
 		 1177 aa  661    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.61933  normal  0.838323 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1669  hypothetical protein  64.07 
 
 		 1210 aa  1518    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2735  hypothetical protein  100 
 
 		 1240 aa  2474    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.37648  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2333  hypothetical protein  66.15 
 
 		 1255 aa  1619    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3001  hypothetical protein  77.6 
 
 		 1244 aa  1862    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.11101 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2449  hypothetical protein  76.49 
 
 		 1243 aa  1872    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.276493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2847  hypothetical protein  68.4 
 
 		 1237 aa  1706    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0013  hypothetical protein  28.18 
 
 		 1240 aa  440  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1618  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1197 aa  423  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115001 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6053  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1192 aa  382  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796735  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5848  hypothetical protein  29.25 
 
 		 1141 aa  368  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0691435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3169  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1149 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3211  hypothetical protein  27.76 
 
 		 1151 aa  362  3e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595014  normal  0.501741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2985  hypothetical protein  27.94 
 
 		 1175 aa  353  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109537  normal  0.516581 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1807  hypothetical protein  27.98 
 
 		 1149 aa  333  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00797206 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1786  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1111 aa  257  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.666865  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2261  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1132 aa  249  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1474  hypothetical protein  26.73 
 
 		 1128 aa  243  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.105081  normal  0.0154551 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3269  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1169 aa  239  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.723226  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0925  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1146 aa  238  4e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0919  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1146 aa  238  7e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1887  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1141 aa  237  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2116  hypothetical protein  26.78 
 
 		 1132 aa  226  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159421  normal  0.0275149 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1909  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1133 aa  225  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.277699 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2037  hypothetical protein  27.74 
 
 		 1088 aa  173  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.86999  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2972  hypothetical protein  24.43 
 
 		 1094 aa  138  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1092  hypothetical protein  23.1 
 
 		 1155 aa  137  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1618  hypothetical protein  24.03 
 
 		 1094 aa  135  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0243061 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1851  hypothetical protein  23.22 
 
 		 1097 aa  125  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.972966 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1307  hypothetical protein  22.84 
 
 		 1162 aa  117  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.684486  normal  0.422338 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2948  hypothetical protein  22.08 
 
 		 1102 aa  111  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.323193 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1716  hypothetical protein  23.93 
 
 		 1093 aa  107  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.513368 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1179  hypothetical protein  22.12 
 
 		 1105 aa  105  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00453923  normal  0.431932 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0149  hypothetical protein  34.54 
 
 		 1024 aa  87.8  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0731967  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0760  hypothetical protein  21.23 
 
 		 996 aa  83.2  0.00000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0264  hypothetical protein  26.6 
 
 		 995 aa  81.3  0.0000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0305  hypothetical protein  25 
 
 		 1040 aa  74.3  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.396383  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0181  hypothetical protein  24.84 
 
 		 943 aa  73.2  0.00000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1861  membrane protein-like protein  27.19 
 
 		 1144 aa  57  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.777283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  27.35 
 
 		 1094 aa  53.5  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  26.5 
 
 		 1079 aa  52.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0705  membrane protein-like protein  30.93 
 
 		 1224 aa  52  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113545  hitchhiker  0.00000969857 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  21.01 
 
 		 1425 aa  46.6  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  20.34 
 
 		 1419 aa  45.8  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0549  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1210 aa  44.7  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>