45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2449 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3957  hypothetical protein  66.15 
 
 		 1232 aa  1595    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4196  hypothetical protein  35.44 
 
 		 1177 aa  660    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.61933  normal  0.838323 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2333  hypothetical protein  67.34 
 
 		 1255 aa  1696    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2449  hypothetical protein  100 
 
 		 1243 aa  2485    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.276493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2847  hypothetical protein  71.91 
 
 		 1237 aa  1799    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2735  hypothetical protein  76.49 
 
 		 1240 aa  1857    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.37648  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3001  hypothetical protein  86.61 
 
 		 1244 aa  2092    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.11101 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1669  hypothetical protein  65.94 
 
 		 1210 aa  1575    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0013  hypothetical protein  28.53 
 
 		 1240 aa  451  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1618  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1197 aa  399  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115001 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6053  hypothetical protein  28.92 
 
 		 1192 aa  376  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796735  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3169  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1149 aa  368  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3211  hypothetical protein  27.22 
 
 		 1151 aa  361  5e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595014  normal  0.501741 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5848  hypothetical protein  28.68 
 
 		 1141 aa  355  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0691435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1807  hypothetical protein  27.64 
 
 		 1149 aa  350  7e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00797206 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2985  hypothetical protein  27.19 
 
 		 1175 aa  345  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109537  normal  0.516581 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1786  hypothetical protein  26.41 
 
 		 1111 aa  269  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.666865  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1474  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1128 aa  259  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.105081  normal  0.0154551 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3269  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1169 aa  254  6e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.723226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2261  hypothetical protein  27.07 
 
 		 1132 aa  249  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1887  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1141 aa  247  8e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2116  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1132 aa  243  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159421  normal  0.0275149 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0919  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1146 aa  238  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0925  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1146 aa  237  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1909  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1133 aa  235  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.277699 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2037  hypothetical protein  25.56 
 
 		 1088 aa  167  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.86999  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2972  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1094 aa  153  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1618  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1094 aa  147  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0243061 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1851  hypothetical protein  22.54 
 
 		 1097 aa  136  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.972966 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1092  hypothetical protein  23.69 
 
 		 1155 aa  136  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2948  hypothetical protein  24.03 
 
 		 1102 aa  122  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.323193 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1179  hypothetical protein  22.41 
 
 		 1105 aa  117  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00453923  normal  0.431932 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1307  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1162 aa  106  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.684486  normal  0.422338 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1716  hypothetical protein  22 
 
 		 1093 aa  91.3  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.513368 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0149  hypothetical protein  41.32 
 
 		 1024 aa  88.6  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0731967  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0760  hypothetical protein  20.75 
 
 		 996 aa  87.4  0.000000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0264  hypothetical protein  26.06 
 
 		 995 aa  80.5  0.0000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0305  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1040 aa  72.8  0.00000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.396383  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0181  hypothetical protein  22.92 
 
 		 943 aa  72  0.00000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1861  membrane protein-like protein  23.21 
 
 		 1144 aa  69.3  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.777283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  28.21 
 
 		 1094 aa  52.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  25.2 
 
 		 1079 aa  52  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0705  membrane protein-like protein  31.25 
 
 		 1224 aa  50.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113545  hitchhiker  0.00000969857 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0763  AsmA family protein  21.58 
 
 		 1070 aa  45.8  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  22.76 
 
 		 1061 aa  45.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>