43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2333 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3957  hypothetical protein  65.29 
 
 		 1232 aa  1582    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4196  hypothetical protein  35.39 
 
 		 1177 aa  662    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.61933  normal  0.838323 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1669  hypothetical protein  81.89 
 
 		 1210 aa  1956    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2735  hypothetical protein  66.15 
 
 		 1240 aa  1589    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.37648  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3001  hypothetical protein  67.79 
 
 		 1244 aa  1649    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.11101 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2333  hypothetical protein  100 
 
 		 1255 aa  2509    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2449  hypothetical protein  67.74 
 
 		 1243 aa  1677    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.276493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2847  hypothetical protein  71.43 
 
 		 1237 aa  1773    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0013  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1240 aa  435  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1618  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1197 aa  425  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115001 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6053  hypothetical protein  28.89 
 
 		 1192 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796735  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5848  hypothetical protein  27.79 
 
 		 1141 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0691435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3169  hypothetical protein  27.77 
 
 		 1149 aa  359  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3211  hypothetical protein  27.26 
 
 		 1151 aa  353  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595014  normal  0.501741 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1807  hypothetical protein  27.92 
 
 		 1149 aa  350  7e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00797206 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2985  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1175 aa  336  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109537  normal  0.516581 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1786  hypothetical protein  27.92 
 
 		 1111 aa  267  7e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.666865  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2261  hypothetical protein  28.44 
 
 		 1132 aa  252  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0925  hypothetical protein  28.02 
 
 		 1146 aa  239  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0919  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1146 aa  237  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1887  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1141 aa  235  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1474  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1128 aa  227  9e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.105081  normal  0.0154551 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2116  hypothetical protein  28.01 
 
 		 1132 aa  223  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159421  normal  0.0275149 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1909  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1133 aa  219  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.277699 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3269  hypothetical protein  23.82 
 
 		 1169 aa  216  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.723226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1618  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1094 aa  177  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0243061 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2972  hypothetical protein  23.34 
 
 		 1094 aa  177  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2037  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1088 aa  167  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.86999  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1851  hypothetical protein  22.67 
 
 		 1097 aa  158  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.972966 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1092  hypothetical protein  22.11 
 
 		 1155 aa  135  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1179  hypothetical protein  21.1 
 
 		 1105 aa  109  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00453923  normal  0.431932 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1307  hypothetical protein  21.64 
 
 		 1162 aa  97.4  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.684486  normal  0.422338 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0264  hypothetical protein  22.42 
 
 		 995 aa  96.7  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0760  hypothetical protein  20.45 
 
 		 996 aa  92.4  5e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2948  hypothetical protein  22.02 
 
 		 1102 aa  91.3  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.323193 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1716  hypothetical protein  20.99 
 
 		 1093 aa  87.8  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.513368 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0149  hypothetical protein  38.21 
 
 		 1024 aa  85.9  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0731967  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0305  hypothetical protein  21.77 
 
 		 1040 aa  75.1  0.000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.396383  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0181  hypothetical protein  25 
 
 		 943 aa  73.6  0.00000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1861  membrane protein-like protein  21.79 
 
 		 1144 aa  66.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.777283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  27.64 
 
 		 1094 aa  54.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  22.69 
 
 		 1425 aa  45.4  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0705  membrane protein-like protein  29.17 
 
 		 1224 aa  45.1  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113545  hitchhiker  0.00000969857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>