42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3211 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6053  hypothetical protein  59.16 
 
 		 1192 aa  1252    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796735  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2985  hypothetical protein  98.96 
 
 		 1175 aa  2237    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109537  normal  0.516581 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1807  hypothetical protein  60.23 
 
 		 1149 aa  1282    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00797206 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5848  hypothetical protein  57.93 
 
 		 1141 aa  1229    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0691435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3169  hypothetical protein  90.73 
 
 		 1149 aa  2044    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3211  hypothetical protein  100 
 
 		 1151 aa  2261    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595014  normal  0.501741 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0013  hypothetical protein  30.41 
 
 		 1240 aa  494  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1618  hypothetical protein  30.94 
 
 		 1197 aa  485  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115001 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4196  hypothetical protein  28.84 
 
 		 1177 aa  364  6e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.61933  normal  0.838323 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2333  hypothetical protein  27.22 
 
 		 1255 aa  360  8e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3957  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1232 aa  360  9e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2847  hypothetical protein  27.07 
 
 		 1237 aa  359  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2449  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1243 aa  357  5e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.276493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2735  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1240 aa  355  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.37648  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3001  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1244 aa  339  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.11101 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1669  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1210 aa  337  5e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0919  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1146 aa  216  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0925  hypothetical protein  23.93 
 
 		 1146 aa  213  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3269  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1169 aa  211  6e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.723226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1786  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1111 aa  209  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.666865  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1887  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1141 aa  208  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1474  hypothetical protein  27.13 
 
 		 1128 aa  207  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.105081  normal  0.0154551 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2261  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1132 aa  207  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2116  hypothetical protein  25.17 
 
 		 1132 aa  204  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159421  normal  0.0275149 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1909  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1133 aa  204  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.277699 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2037  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1088 aa  187  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.86999  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1307  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1162 aa  153  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.684486  normal  0.422338 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2972  hypothetical protein  23.4 
 
 		 1094 aa  127  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1618  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1094 aa  126  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0243061 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0149  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1024 aa  125  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0731967  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1092  hypothetical protein  22.39 
 
 		 1155 aa  122  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1716  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1093 aa  118  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.513368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1851  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1097 aa  117  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.972966 
 
 
-
 
NC_002978  WD0305  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1040 aa  100  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.396383  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2948  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1102 aa  97.4  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.323193 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0264  hypothetical protein  21.3 
 
 		 995 aa  92  6e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1179  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1105 aa  91.3  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00453923  normal  0.431932 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0181  hypothetical protein  20.91 
 
 		 943 aa  91.3  1e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0760  hypothetical protein  24.67 
 
 		 996 aa  74.7  0.000000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1861  membrane protein-like protein  28.03 
 
 		 1144 aa  57  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.777283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4018  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1418 aa  46.6  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  27.18 
 
 		 1061 aa  44.7  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>