40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1179 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1179  hypothetical protein  100 
 
 		 1105 aa  2086    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00453923  normal  0.431932 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1618  hypothetical protein  33.7 
 
 		 1094 aa  465  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0243061 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2972  hypothetical protein  33.52 
 
 		 1094 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1851  hypothetical protein  33.36 
 
 		 1097 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.972966 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1716  hypothetical protein  31.16 
 
 		 1093 aa  414  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.513368 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1092  hypothetical protein  30.62 
 
 		 1155 aa  412  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3269  hypothetical protein  24.33 
 
 		 1169 aa  189  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.723226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2037  hypothetical protein  28.42 
 
 		 1088 aa  173  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.86999  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1786  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1111 aa  157  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.666865  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1474  hypothetical protein  24.06 
 
 		 1128 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.105081  normal  0.0154551 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1887  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1141 aa  128  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0925  hypothetical protein  23 
 
 		 1146 aa  119  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0919  hypothetical protein  22.87 
 
 		 1146 aa  117  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2261  hypothetical protein  22.52 
 
 		 1132 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1307  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1162 aa  116  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.684486  normal  0.422338 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2847  hypothetical protein  22.24 
 
 		 1237 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3001  hypothetical protein  21.57 
 
 		 1244 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.11101 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2449  hypothetical protein  21.95 
 
 		 1243 aa  115  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.276493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2735  hypothetical protein  22.2 
 
 		 1240 aa  112  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.37648  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2333  hypothetical protein  21.02 
 
 		 1255 aa  111  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0149  hypothetical protein  30.21 
 
 		 1024 aa  111  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0731967  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1909  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1133 aa  108  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.277699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3957  hypothetical protein  22.25 
 
 		 1232 aa  102  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1669  hypothetical protein  22.24 
 
 		 1210 aa  101  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4196  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1177 aa  100  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.61933  normal  0.838323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1807  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1149 aa  91.3  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00797206 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2948  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1102 aa  90.5  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.323193 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3211  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1151 aa  90.1  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595014  normal  0.501741 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0013  hypothetical protein  21.67 
 
 		 1240 aa  87.4  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6053  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1192 aa  85.1  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796735  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3169  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1149 aa  85.1  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2985  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1175 aa  80.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109537  normal  0.516581 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5848  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1141 aa  79.7  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0691435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1618  hypothetical protein  23.84 
 
 		 1197 aa  79.7  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115001 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0760  hypothetical protein  20.35 
 
 		 996 aa  75.1  0.000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0305  hypothetical protein  19.29 
 
 		 1040 aa  70.1  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.396383  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0264  hypothetical protein  18.98 
 
 		 995 aa  66.6  0.000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0181  hypothetical protein  22.43 
 
 		 943 aa  56.6  0.000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1861  membrane protein-like protein  25.25 
 
 		 1144 aa  48.9  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.777283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3187  exonuclease VII, small subunit  24.68 
 
 		 1380 aa  47.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>