42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1092 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1092  hypothetical protein  100 
 
 		 1155 aa  2288    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2972  hypothetical protein  36.49 
 
 		 1094 aa  599  1e-169  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1851  hypothetical protein  37.41 
 
 		 1097 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.972966 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1618  hypothetical protein  37.16 
 
 		 1094 aa  595  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0243061 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1716  hypothetical protein  30.1 
 
 		 1093 aa  441  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.513368 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1179  hypothetical protein  30.41 
 
 		 1105 aa  416  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00453923  normal  0.431932 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3269  hypothetical protein  23.54 
 
 		 1169 aa  211  8e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.723226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3957  hypothetical protein  25 
 
 		 1232 aa  164  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2037  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1088 aa  159  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.86999  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2735  hypothetical protein  23.1 
 
 		 1240 aa  142  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.37648  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2333  hypothetical protein  22.47 
 
 		 1255 aa  138  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2449  hypothetical protein  23 
 
 		 1243 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.276493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1307  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1162 aa  135  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.684486  normal  0.422338 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2847  hypothetical protein  22.31 
 
 		 1237 aa  135  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1786  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1111 aa  133  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.666865  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3001  hypothetical protein  22.87 
 
 		 1244 aa  132  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.11101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3211  hypothetical protein  22.29 
 
 		 1151 aa  124  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595014  normal  0.501741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6053  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1192 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796735  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1807  hypothetical protein  22.47 
 
 		 1149 aa  121  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00797206 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1669  hypothetical protein  21.51 
 
 		 1210 aa  120  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5848  hypothetical protein  23.88 
 
 		 1141 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0691435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2985  hypothetical protein  22.6 
 
 		 1175 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109537  normal  0.516581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3169  hypothetical protein  21.16 
 
 		 1149 aa  116  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0149  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1024 aa  109  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0731967  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1887  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1141 aa  107  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1909  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1133 aa  107  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.277699 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0264  hypothetical protein  19.7 
 
 		 995 aa  101  8e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2116  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1132 aa  101  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159421  normal  0.0275149 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0013  hypothetical protein  21.93 
 
 		 1240 aa  99.4  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0760  hypothetical protein  19.2 
 
 		 996 aa  99  5e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4196  hypothetical protein  22.47 
 
 		 1177 aa  97.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.61933  normal  0.838323 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1474  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1128 aa  95.1  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.105081  normal  0.0154551 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1618  hypothetical protein  23.84 
 
 		 1197 aa  92  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115001 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2261  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1132 aa  90.9  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0919  hypothetical protein  21.45 
 
 		 1146 aa  89.4  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0925  hypothetical protein  21.45 
 
 		 1146 aa  89  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0305  hypothetical protein  22.13 
 
 		 1040 aa  71.2  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.396383  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2948  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1102 aa  63.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.323193 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0181  hypothetical protein  25.45 
 
 		 943 aa  61.2  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1861  membrane protein-like protein  24.14 
 
 		 1144 aa  55.1  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.777283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1425 aa  48.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1309 aa  47  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>