40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1807 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6053  hypothetical protein  60.98 
 
 
1192 aa  1300    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796735  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3211  hypothetical protein  60.02 
 
 
1151 aa  1309    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595014  normal  0.501741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2985  hypothetical protein  60.11 
 
 
1175 aa  1293    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109537  normal  0.516581 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1807  hypothetical protein  100 
 
 
1149 aa  2246    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00797206 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5848  hypothetical protein  59.91 
 
 
1141 aa  1267    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0691435  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3169  hypothetical protein  60.92 
 
 
1149 aa  1333    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0013  hypothetical protein  31.19 
 
 
1240 aa  497  1e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1618  hypothetical protein  31.59 
 
 
1197 aa  482  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115001 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2333  hypothetical protein  28.03 
 
 
1255 aa  379  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3957  hypothetical protein  27.13 
 
 
1232 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133341  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4196  hypothetical protein  28.63 
 
 
1177 aa  369  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.61933  normal  0.838323 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2449  hypothetical protein  27.64 
 
 
1243 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.276493  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2847  hypothetical protein  27.38 
 
 
1237 aa  360  7e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531353  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2735  hypothetical protein  28.02 
 
 
1240 aa  347  5e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.37648  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1669  hypothetical protein  27.05 
 
 
1210 aa  339  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285065  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3001  hypothetical protein  27.69 
 
 
1244 aa  338  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.11101 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1909  hypothetical protein  27.98 
 
 
1133 aa  234  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.277699 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2261  hypothetical protein  26.91 
 
 
1132 aa  232  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0919  hypothetical protein  27.23 
 
 
1146 aa  229  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0925  hypothetical protein  27.42 
 
 
1146 aa  229  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2116  hypothetical protein  27.16 
 
 
1132 aa  226  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159421  normal  0.0275149 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1474  hypothetical protein  28.78 
 
 
1128 aa  225  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.105081  normal  0.0154551 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1786  hypothetical protein  25.64 
 
 
1111 aa  223  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.666865  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1887  hypothetical protein  27.59 
 
 
1141 aa  219  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3269  hypothetical protein  24.79 
 
 
1169 aa  212  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.723226  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2037  hypothetical protein  26.01 
 
 
1088 aa  144  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.86999  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1307  hypothetical protein  23.75 
 
 
1162 aa  140  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.684486  normal  0.422338 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1618  hypothetical protein  23.54 
 
 
1094 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0243061 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1092  hypothetical protein  23.01 
 
 
1155 aa  127  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2972  hypothetical protein  23.59 
 
 
1094 aa  126  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1851  hypothetical protein  23.88 
 
 
1097 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.972966 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0149  hypothetical protein  26.53 
 
 
1024 aa  110  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0731967  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1716  hypothetical protein  24.13 
 
 
1093 aa  101  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.513368 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1179  hypothetical protein  26.3 
 
 
1105 aa  91.7  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00453923  normal  0.431932 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0760  hypothetical protein  20.81 
 
 
996 aa  82  0.00000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0264  hypothetical protein  20.03 
 
 
995 aa  81.3  0.0000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2948  hypothetical protein  29.5 
 
 
1102 aa  77.4  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.323193 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0181  hypothetical protein  25.26 
 
 
943 aa  77  0.000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0305  hypothetical protein  20.74 
 
 
1040 aa  73.9  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.396383  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1861  membrane protein-like protein  30.97 
 
 
1144 aa  60.1  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.777283  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>