55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2037 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2037  hypothetical protein  100 
 
 		 1088 aa  2124    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.86999  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3269  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1169 aa  305  4.0000000000000003e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.723226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0149  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1024 aa  197  7e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0731967  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3211  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1151 aa  187  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595014  normal  0.501741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2985  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1175 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109537  normal  0.516581 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2948  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1102 aa  174  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.323193 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1179  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1105 aa  173  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00453923  normal  0.431932 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2333  hypothetical protein  23.98 
 
 		 1255 aa  173  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2735  hypothetical protein  27.74 
 
 		 1240 aa  173  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.37648  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1786  hypothetical protein  22.4 
 
 		 1111 aa  171  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.666865  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3169  hypothetical protein  26.48 
 
 		 1149 aa  169  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1307  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1162 aa  169  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.684486  normal  0.422338 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0760  hypothetical protein  22.27 
 
 		 996 aa  169  2.9999999999999998e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0264  hypothetical protein  22 
 
 		 995 aa  167  9e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6053  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1192 aa  165  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796735  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1618  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1094 aa  164  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0243061 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2972  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1094 aa  164  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2449  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1243 aa  162  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.276493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2847  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1237 aa  158  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1092  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1155 aa  157  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3001  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1244 aa  156  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.11101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1716  hypothetical protein  24.57 
 
 		 1093 aa  154  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.513368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5848  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1141 aa  153  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0691435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1851  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1097 aa  151  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.972966 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2261  hypothetical protein  24.44 
 
 		 1132 aa  150  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0919  hypothetical protein  23.4 
 
 		 1146 aa  145  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0925  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1146 aa  145  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4196  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1177 aa  143  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.61933  normal  0.838323 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0013  hypothetical protein  23.77 
 
 		 1240 aa  142  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1887  hypothetical protein  22.81 
 
 		 1141 aa  140  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3957  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1232 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1669  hypothetical protein  24 
 
 		 1210 aa  138  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1474  hypothetical protein  22.87 
 
 		 1128 aa  134  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.105081  normal  0.0154551 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1618  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1197 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115001 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0181  hypothetical protein  32.26 
 
 		 943 aa  126  2e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1807  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1149 aa  126  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00797206 
 
 
-
 
NC_002978  WD0305  hypothetical protein  30.39 
 
 		 1040 aa  121  9e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.396383  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1909  hypothetical protein  21.97 
 
 		 1133 aa  102  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.277699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2116  hypothetical protein  21.69 
 
 		 1132 aa  97.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159421  normal  0.0275149 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1080 aa  61.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  22.62 
 
 		 1061 aa  57.4  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  21.94 
 
 		 1061 aa  55.1  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1861  membrane protein-like protein  25.64 
 
 		 1144 aa  53.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.777283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  22.7 
 
 		 1079 aa  52  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  21.05 
 
 		 1094 aa  50.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0705  membrane protein-like protein  29.29 
 
 		 1224 aa  50.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113545  hitchhiker  0.00000969857 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1379 aa  49.3  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3774  membrane protein-like  22.16 
 
 		 1234 aa  48.9  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0394533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2358  hypothetical protein  22.44 
 
 		 1102 aa  47  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1378 aa  47  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4018  hypothetical protein  27.18 
 
 		 1418 aa  46.6  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1381 aa  45.8  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  27.59 
 
 		 1304 aa  45.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  29 
 
 		 1425 aa  45.4  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0549  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1210 aa  44.7  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>