44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3169 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5848  hypothetical protein  57.87 
 
 		 1141 aa  1247    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0691435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3169  hypothetical protein  100 
 
 		 1149 aa  2254    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3211  hypothetical protein  90.73 
 
 		 1151 aa  2011    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595014  normal  0.501741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6053  hypothetical protein  58.14 
 
 		 1192 aa  1248    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796735  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2985  hypothetical protein  90.55 
 
 		 1175 aa  1988    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109537  normal  0.516581 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1807  hypothetical protein  61.16 
 
 		 1149 aa  1285    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00797206 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0013  hypothetical protein  31.6 
 
 		 1240 aa  505  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1618  hypothetical protein  31.19 
 
 		 1197 aa  481  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115001 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4196  hypothetical protein  29.58 
 
 		 1177 aa  370  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.61933  normal  0.838323 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2847  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1237 aa  360  6e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2333  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1255 aa  359  9.999999999999999e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2449  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1243 aa  357  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.276493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2735  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1240 aa  355  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.37648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3957  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1232 aa  355  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3001  hypothetical protein  27.98 
 
 		 1244 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.11101 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1669  hypothetical protein  27.15 
 
 		 1210 aa  339  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0919  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1146 aa  219  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0925  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1146 aa  216  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2261  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1132 aa  214  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1474  hypothetical protein  28.36 
 
 		 1128 aa  213  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.105081  normal  0.0154551 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2116  hypothetical protein  25 
 
 		 1132 aa  205  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159421  normal  0.0275149 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1786  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1111 aa  204  9e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.666865  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1887  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1141 aa  202  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3269  hypothetical protein  23.8 
 
 		 1169 aa  198  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.723226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2037  hypothetical protein  26.48 
 
 		 1088 aa  170  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.86999  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1307  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1162 aa  143  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.684486  normal  0.422338 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1618  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1094 aa  126  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0243061 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1716  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1093 aa  126  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.513368 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2972  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1094 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0149  hypothetical protein  25.61 
 
 		 1024 aa  115  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0731967  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1092  hypothetical protein  20.93 
 
 		 1155 aa  114  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1851  hypothetical protein  23.19 
 
 		 1097 aa  103  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.972966 
 
 
-
 
NC_002978  WD0305  hypothetical protein  23.96 
 
 		 1040 aa  100  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.396383  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2948  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1102 aa  94.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.323193 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1179  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1105 aa  86.3  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00453923  normal  0.431932 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0264  hypothetical protein  24.43 
 
 		 995 aa  84  0.00000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0181  hypothetical protein  27.13 
 
 		 943 aa  83.2  0.00000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0760  hypothetical protein  25.51 
 
 		 996 aa  77.8  0.000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1861  membrane protein-like protein  29.1 
 
 		 1144 aa  65.9  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.777283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  29.06 
 
 		 1079 aa  51.6  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1080 aa  51.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  28.16 
 
 		 1061 aa  47.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  27.18 
 
 		 1061 aa  46.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1371  AsmA family protein  32.58 
 
 		 1104 aa  46.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000870938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>