40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0925 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0925  hypothetical protein  100 
 
 
1146 aa  2308    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2261  hypothetical protein  81.98 
 
 
1132 aa  1867    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0919  hypothetical protein  99.65 
 
 
1146 aa  2295    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1474  hypothetical protein  34.77 
 
 
1128 aa  632  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.105081  normal  0.0154551 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2116  hypothetical protein  33.1 
 
 
1132 aa  586  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159421  normal  0.0275149 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1786  hypothetical protein  32.44 
 
 
1111 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.666865  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1909  hypothetical protein  32.99 
 
 
1133 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.277699 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1887  hypothetical protein  31.7 
 
 
1141 aa  557  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4196  hypothetical protein  28.69 
 
 
1177 aa  263  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.61933  normal  0.838323 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2847  hypothetical protein  26.92 
 
 
1237 aa  258  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531353  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3001  hypothetical protein  27.79 
 
 
1244 aa  256  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.11101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2735  hypothetical protein  27.58 
 
 
1240 aa  256  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.37648  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2333  hypothetical protein  28.15 
 
 
1255 aa  254  9.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3957  hypothetical protein  26.03 
 
 
1232 aa  249  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133341  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2449  hypothetical protein  26.51 
 
 
1243 aa  248  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.276493  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6053  hypothetical protein  27.31 
 
 
1192 aa  243  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796735  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1669  hypothetical protein  26.11 
 
 
1210 aa  239  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285065  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5848  hypothetical protein  26.72 
 
 
1141 aa  227  8e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0691435  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3211  hypothetical protein  25.49 
 
 
1151 aa  225  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595014  normal  0.501741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3169  hypothetical protein  24.22 
 
 
1149 aa  224  8e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0013  hypothetical protein  24.54 
 
 
1240 aa  224  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1807  hypothetical protein  27.53 
 
 
1149 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00797206 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3269  hypothetical protein  25.86 
 
 
1169 aa  215  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.723226  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1618  hypothetical protein  25.48 
 
 
1197 aa  211  8e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115001 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2985  hypothetical protein  25.63 
 
 
1175 aa  210  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109537  normal  0.516581 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2037  hypothetical protein  23.47 
 
 
1088 aa  154  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.86999  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1307  hypothetical protein  22.85 
 
 
1162 aa  134  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.684486  normal  0.422338 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1179  hypothetical protein  23.21 
 
 
1105 aa  125  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00453923  normal  0.431932 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1618  hypothetical protein  22.01 
 
 
1094 aa  107  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0243061 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1716  hypothetical protein  23.28 
 
 
1093 aa  106  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.513368 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2972  hypothetical protein  22.28 
 
 
1094 aa  104  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1851  hypothetical protein  21.32 
 
 
1097 aa  104  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.972966 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0760  hypothetical protein  20.61 
 
 
996 aa  92  5e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0149  hypothetical protein  21.51 
 
 
1024 aa  89.7  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0731967  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1092  hypothetical protein  21.38 
 
 
1155 aa  89.4  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2948  hypothetical protein  25.09 
 
 
1102 aa  76.3  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.323193 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0181  hypothetical protein  25 
 
 
943 aa  73.2  0.00000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0264  hypothetical protein  21.97 
 
 
995 aa  68.6  0.0000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0305  hypothetical protein  25.77 
 
 
1040 aa  67.8  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.396383  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1861  membrane protein-like protein  25.24 
 
 
1144 aa  51.6  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.777283  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>