40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2948 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2948  hypothetical protein  100 
 
 		 1102 aa  2101    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.323193 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0149  hypothetical protein  31.51 
 
 		 1024 aa  194  8e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0731967  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2037  hypothetical protein  24.67 
 
 		 1088 aa  183  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.86999  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3269  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1169 aa  171  8e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.723226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2449  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1243 aa  129  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.276493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5848  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1141 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0691435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1786  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1111 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.666865  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2735  hypothetical protein  22.08 
 
 		 1240 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.37648  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3001  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1244 aa  112  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.11101 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0013  hypothetical protein  25.08 
 
 		 1240 aa  110  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1618  hypothetical protein  24.44 
 
 		 1197 aa  109  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3957  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1232 aa  106  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1716  hypothetical protein  23.37 
 
 		 1093 aa  105  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.513368 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4196  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1177 aa  105  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.61933  normal  0.838323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6053  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1192 aa  105  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796735  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3211  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1151 aa  103  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595014  normal  0.501741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3169  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1149 aa  101  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2985  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1175 aa  99.4  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109537  normal  0.516581 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1179  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1105 aa  98.6  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00453923  normal  0.431932 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1307  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1162 aa  96.7  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.684486  normal  0.422338 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2333  hypothetical protein  21.96 
 
 		 1255 aa  96.3  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1092  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1155 aa  94.7  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2847  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1237 aa  94.7  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1669  hypothetical protein  22.32 
 
 		 1210 aa  89.7  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1909  hypothetical protein  21.88 
 
 		 1133 aa  86.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.277699 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2261  hypothetical protein  20.63 
 
 		 1132 aa  83.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0181  hypothetical protein  24.86 
 
 		 943 aa  83.2  0.00000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0264  hypothetical protein  18.53 
 
 		 995 aa  79.3  0.0000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0305  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1040 aa  77  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.396383  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1474  hypothetical protein  33.64 
 
 		 1128 aa  76.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.105081  normal  0.0154551 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1887  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1141 aa  76.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0925  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1146 aa  75.5  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0919  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1146 aa  75.5  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0760  hypothetical protein  28.57 
 
 		 996 aa  75.5  0.000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2116  hypothetical protein  32.73 
 
 		 1132 aa  74.7  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.159421  normal  0.0275149 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1807  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1149 aa  72  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00797206 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1851  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1097 aa  66.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.972966 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2972  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1094 aa  60.1  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1618  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1094 aa  59.3  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0243061 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1861  membrane protein-like protein  28.07 
 
 		 1144 aa  51.6  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.777283  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>