162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1861 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1861  membrane protein-like protein  100 
 
 		 1144 aa  2306    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.777283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  30.7 
 
 		 1094 aa  100  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  29.38 
 
 		 1061 aa  100  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1371  AsmA family protein  24.39 
 
 		 1104 aa  100  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000870938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  28.32 
 
 		 1061 aa  95.1  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1080 aa  94  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  21.24 
 
 		 1265 aa  89.4  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2358  hypothetical protein  28.63 
 
 		 1102 aa  88.2  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  24.34 
 
 		 1079 aa  86.3  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  28.06 
 
 		 1341 aa  85.1  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1306 aa  80.5  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6053  hypothetical protein  28.87 
 
 		 1192 aa  79.7  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.796735  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1264 aa  78.6  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  25.59 
 
 		 1291 aa  77.4  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0763  AsmA family protein  19.71 
 
 		 1070 aa  76.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116181  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  27.63 
 
 		 1283 aa  77  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1274 aa  75.1  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  29.86 
 
 		 1261 aa  75.1  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1284 aa  75.1  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5848  hypothetical protein  28.02 
 
 		 1141 aa  73.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0691435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3774  membrane protein-like  26.42 
 
 		 1234 aa  73.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0394533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1286 aa  73.2  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1309 aa  72.8  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  21.88 
 
 		 1323 aa  70.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  22.39 
 
 		 1307 aa  70.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1307 aa  70.1  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3001  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1244 aa  70.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.11101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2847  hypothetical protein  24 
 
 		 1237 aa  70.1  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  21.76 
 
 		 1384 aa  70.1  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3269  hypothetical protein  26 
 
 		 1169 aa  70.5  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.723226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0512  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1153 aa  69.7  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.350168  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1669  hypothetical protein  21.79 
 
 		 1210 aa  68.9  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2449  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1243 aa  68.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.276493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3169  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1149 aa  67.8  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2333  hypothetical protein  21.79 
 
 		 1255 aa  67.8  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1645  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1153 aa  67.4  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000756943  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  22.14 
 
 		 1307 aa  67.4  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  30.05 
 
 		 1379 aa  66.6  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  21.88 
 
 		 1305 aa  67  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  31.29 
 
 		 1441 aa  66.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0705  membrane protein-like protein  26.02 
 
 		 1224 aa  66.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113545  hitchhiker  0.00000969857 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  21.73 
 
 		 1277 aa  65.9  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1284 aa  65.5  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1786  hypothetical protein  30.63 
 
 		 1111 aa  63.9  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.666865  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  24.81 
 
 		 1276 aa  63.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  22.12 
 
 		 1288 aa  63.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  23.53 
 
 		 1379 aa  63.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1716  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1093 aa  63.2  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.513368 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1092  hypothetical protein  21.07 
 
 		 1155 aa  62.8  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  28.14 
 
 		 1425 aa  62.4  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  27.85 
 
 		 1300 aa  62  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  24.44 
 
 		 1273 aa  62  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  27.57 
 
 		 1420 aa  62  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  20.97 
 
 		 1301 aa  61.6  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  24.44 
 
 		 1273 aa  61.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0149  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1024 aa  61.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0731967  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1276 aa  60.8  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  24.49 
 
 		 1266 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  25.51 
 
 		 1266 aa  60.1  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  23.59 
 
 		 1443 aa  60.1  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1266 aa  60.1  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1266 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1266 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  28.06 
 
 		 1450 aa  59.7  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1266 aa  59.7  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2037  hypothetical protein  21.69 
 
 		 1088 aa  59.7  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.86999  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1266 aa  59.7  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  24.49 
 
 		 1266 aa  58.9  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  33.05 
 
 		 1141 aa  58.9  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2985  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1175 aa  58.9  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109537  normal  0.516581 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1266 aa  58.9  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3211  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1151 aa  59.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.595014  normal  0.501741 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  22.18 
 
 		 1419 aa  58.9  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0760  hypothetical protein  21.28 
 
 		 996 aa  58.5  0.0000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1266 aa  58.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1266 aa  58.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1266 aa  58.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  25.1 
 
 		 1266 aa  58.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2735  hypothetical protein  22.35 
 
 		 1240 aa  58.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.37648  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1618  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1197 aa  58.2  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115001 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0549  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1210 aa  58.2  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1307  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1162 aa  57.4  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.684486  normal  0.422338 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  21.76 
 
 		 1277 aa  57.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3957  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1232 aa  57.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  24.89 
 
 		 1384 aa  57  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  25.3 
 
 		 1381 aa  57  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0928  hypothetical protein  25.88 
 
 		 655 aa  57.4  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.903286  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  29.93 
 
 		 1472 aa  57  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  24.08 
 
 		 1266 aa  57  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0819  hypothetical protein  25.55 
 
 		 856 aa  56.2  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1290 aa  55.8  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  21.94 
 
 		 1392 aa  55.5  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0925  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1146 aa  55.1  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0919  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1146 aa  55.1  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1090  hypothetical protein  25.11 
 
 		 821 aa  54.3  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.665331  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0305  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1040 aa  53.9  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.396383  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0264  hypothetical protein  21.53 
 
 		 995 aa  53.5  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  28.5 
 
 		 1419 aa  53.5  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  27.45 
 
 		 1426 aa  53.5  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1398 aa  52.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>