177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0874 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  100 
 
 		 1080 aa  2203    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  45.65 
 
 		 1061 aa  918    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  37.52 
 
 		 1094 aa  699    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  55.65 
 
 		 1079 aa  1231    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0763  AsmA family protein  40.64 
 
 		 1070 aa  798    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  45.08 
 
 		 1061 aa  923    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1371  AsmA family protein  49.38 
 
 		 1104 aa  1048    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000870938  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2358  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1102 aa  280  9e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3774  membrane protein-like  23.74 
 
 		 1234 aa  103  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0394533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1861  membrane protein-like protein  23 
 
 		 1144 aa  80.9  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.777283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1313  hypothetical protein  23.2 
 
 		 809 aa  80.5  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000526597  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0705  membrane protein-like protein  23.04 
 
 		 1224 aa  73.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113545  hitchhiker  0.00000969857 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  24.05 
 
 		 812 aa  71.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  23.77 
 
 		 699 aa  70.1  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  26.2 
 
 		 695 aa  69.7  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  22.46 
 
 		 742 aa  68.9  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  28.92 
 
 		 611 aa  66.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0549  hypothetical protein  24.18 
 
 		 1210 aa  64.7  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  25.09 
 
 		 695 aa  64.3  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  27.59 
 
 		 1013 aa  63.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  23.1 
 
 		 649 aa  61.6  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  24.2 
 
 		 506 aa  61.6  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  28.73 
 
 		 677 aa  60.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  24.15 
 
 		 632 aa  61.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2037  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1088 aa  61.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.86999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1419 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  25.61 
 
 		 1436 aa  60.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  24.49 
 
 		 640 aa  59.7  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  23.81 
 
 		 712 aa  59.3  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  25.41 
 
 		 735 aa  58.5  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  23 
 
 		 656 aa  57.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  24.91 
 
 		 599 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  27.86 
 
 		 893 aa  56.6  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1399 aa  57  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1399 aa  57  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1399 aa  57  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  27.69 
 
 		 789 aa  55.8  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  23.05 
 
 		 703 aa  56.2  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  23.93 
 
 		 1323 aa  55.5  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1399 aa  55.1  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1398 aa  54.7  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1398 aa  54.7  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0305  hypothetical protein  26.81 
 
 		 1040 aa  54.7  0.000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.396383  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1045  hypothetical protein  23.03 
 
 		 921 aa  54.7  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.665952  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1399 aa  53.9  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  24.17 
 
 		 669 aa  54.3  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0149  hypothetical protein  23.17 
 
 		 1024 aa  53.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0731967  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1618  hypothetical protein  27.19 
 
 		 1197 aa  53.1  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115001 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  25.4 
 
 		 725 aa  53.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  24.87 
 
 		 1341 aa  53.1  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  21.89 
 
 		 797 aa  52.8  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1682  hypothetical protein  20.75 
 
 		 1095 aa  52.8  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.175691  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1265 aa  52.8  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2829  hypothetical protein  22.4 
 
 		 1200 aa  52.4  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.832798  hitchhiker  0.000000897971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  24.32 
 
 		 689 aa  52  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  24.32 
 
 		 689 aa  52  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  24.41 
 
 		 1301 aa  52  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  25.45 
 
 		 1515 aa  51.6  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  31.71 
 
 		 1077 aa  51.2  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1392 aa  51.6  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1390 aa  50.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  24.22 
 
 		 682 aa  51.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3169  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1149 aa  51.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1397 aa  50.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  21.86 
 
 		 782 aa  51.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0928  hypothetical protein  23.48 
 
 		 655 aa  51.2  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.903286  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  21.24 
 
 		 1384 aa  51.2  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  28.09 
 
 		 645 aa  50.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1397 aa  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1785  hypothetical protein  29.79 
 
 		 470 aa  50.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  22.36 
 
 		 670 aa  50.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1397 aa  50.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1397 aa  50.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1397 aa  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  23.84 
 
 		 611 aa  50.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1368 aa  50.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  24.83 
 
 		 1304 aa  49.7  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  24.48 
 
 		 791 aa  49.7  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  31.09 
 
 		 709 aa  49.7  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  23.24 
 
 		 1276 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  24 
 
 		 1397 aa  49.7  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1372 aa  50.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  23.5 
 
 		 680 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  23.24 
 
 		 1275 aa  49.3  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3957  hypothetical protein  25.47 
 
 		 1232 aa  49.3  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0181  hypothetical protein  22.22 
 
 		 943 aa  49.3  0.0004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2314  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1189 aa  49.3  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  21.77 
 
 		 1379 aa  49.3  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  22.22 
 
 		 502 aa  48.9  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  23.69 
 
 		 705 aa  48.9  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  23.73 
 
 		 719 aa  48.9  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  22.22 
 
 		 508 aa  48.9  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  30.09 
 
 		 696 aa  48.9  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0225  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1261 aa  48.5  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.290808  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  24.63 
 
 		 604 aa  48.9  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1669  hypothetical protein  20.33 
 
 		 1210 aa  48.5  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  23.72 
 
 		 1383 aa  48.5  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  27.7 
 
 		 826 aa  48.1  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  22.74 
 
 		 602 aa  47.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4334  hypothetical protein  23.42 
 
 		 1169 aa  47.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0904318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>