165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3362 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  45.08 
 
 		 1080 aa  923    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  44.29 
 
 		 1079 aa  901    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  100 
 
 		 1061 aa  2148    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0763  AsmA family protein  40.55 
 
 		 1070 aa  759    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116181  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  37.35 
 
 		 1094 aa  709    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1371  AsmA family protein  50.24 
 
 		 1104 aa  1053    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000870938  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  93.31 
 
 		 1061 aa  1985    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2358  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1102 aa  234  8.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3774  membrane protein-like  29.63 
 
 		 1234 aa  98.6  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0394533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  27.04 
 
 		 632 aa  90.1  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1861  membrane protein-like protein  28.32 
 
 		 1144 aa  83.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.777283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0705  membrane protein-like protein  25.38 
 
 		 1224 aa  78.2  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113545  hitchhiker  0.00000969857 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0549  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1210 aa  70.9  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  26.73 
 
 		 669 aa  69.3  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  26.15 
 
 		 740 aa  67.8  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  23.64 
 
 		 649 aa  67  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1397 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  24.48 
 
 		 782 aa  65.5  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  25.26 
 
 		 765 aa  65.1  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1045  hypothetical protein  25.95 
 
 		 921 aa  63.9  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.665952  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  25.26 
 
 		 765 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1397 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  24.23 
 
 		 656 aa  63.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1397 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1397 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1397 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1372 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1368 aa  63.2  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  25 
 
 		 657 aa  63.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1397 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  25.81 
 
 		 688 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1399 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1398 aa  62.4  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1398 aa  62  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  25 
 
 		 688 aa  61.6  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  26.34 
 
 		 791 aa  61.6  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1399 aa  61.6  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1399 aa  61.6  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1399 aa  61.6  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  25 
 
 		 688 aa  61.6  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0634  hypothetical protein  27.01 
 
 		 856 aa  61.2  0.00000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1313  hypothetical protein  27.85 
 
 		 809 aa  61.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000526597  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1399 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1400  hypothetical protein  27.01 
 
 		 843 aa  60.8  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.71275  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0928  hypothetical protein  24.36 
 
 		 655 aa  60.1  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.903286  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0555  hypothetical protein  27.01 
 
 		 843 aa  60.5  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  21.22 
 
 		 669 aa  59.3  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  21.92 
 
 		 732 aa  58.9  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  23.94 
 
 		 688 aa  58.5  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  26.7 
 
 		 791 aa  57.4  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  23.96 
 
 		 765 aa  57.4  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  23.96 
 
 		 765 aa  57.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  23.96 
 
 		 765 aa  57.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1384 aa  57.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  23.93 
 
 		 1323 aa  57  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  24.21 
 
 		 810 aa  57  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  23.81 
 
 		 688 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1264 aa  56.2  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1394 aa  56.2  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  24.48 
 
 		 759 aa  55.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  23.81 
 
 		 688 aa  55.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0181  hypothetical protein  24.74 
 
 		 943 aa  55.8  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  26.11 
 
 		 506 aa  55.5  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2037  hypothetical protein  21.94 
 
 		 1088 aa  55.1  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.86999  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1341 aa  55.1  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  23.28 
 
 		 678 aa  54.7  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  23.42 
 
 		 735 aa  54.7  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  23.96 
 
 		 765 aa  54.3  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  22.8 
 
 		 832 aa  53.5  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  25 
 
 		 664 aa  53.5  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  23.44 
 
 		 765 aa  53.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  24.94 
 
 		 761 aa  53.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0305  hypothetical protein  28.26 
 
 		 1040 aa  53.1  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.396383  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1091  hypothetical protein  29.67 
 
 		 853 aa  52.8  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  25 
 
 		 1428 aa  52.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0819  hypothetical protein  24.39 
 
 		 856 aa  52.8  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  25.41 
 
 		 1384 aa  53.1  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  22.34 
 
 		 739 aa  52.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1887  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1141 aa  52.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  21.4 
 
 		 812 aa  52.8  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  22.34 
 
 		 745 aa  52.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1669  hypothetical protein  22.76 
 
 		 1210 aa  52.4  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1618  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1197 aa  52.4  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115001 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  21.08 
 
 		 742 aa  52  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  24.19 
 
 		 680 aa  52  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1419 aa  52  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  24.08 
 
 		 670 aa  52  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  28.93 
 
 		 1077 aa  51.6  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  23.81 
 
 		 691 aa  51.2  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  29.66 
 
 		 797 aa  50.8  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  23.44 
 
 		 764 aa  51.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  21.43 
 
 		 839 aa  50.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  22.67 
 
 		 1430 aa  51.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  22.93 
 
 		 1398 aa  50.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  20.47 
 
 		 1379 aa  51.2  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2314  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1189 aa  51.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1273 aa  50.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  25.43 
 
 		 606 aa  50.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1283 aa  50.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  26.55 
 
 		 696 aa  50.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>