112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0721 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  51.3 
 
 		 669 aa  690    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  46.88 
 
 		 688 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  81.25 
 
 		 740 aa  1182    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  47.51 
 
 		 688 aa  644    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  47.99 
 
 		 688 aa  654    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  56.73 
 
 		 791 aa  804    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  57.38 
 
 		 735 aa  819    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  48.63 
 
 		 689 aa  671    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  95.82 
 
 		 765 aa  1464    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  47.21 
 
 		 688 aa  645    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  48.49 
 
 		 689 aa  668    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  47.77 
 
 		 782 aa  696    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  46.92 
 
 		 688 aa  636    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  47.38 
 
 		 688 aa  642    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  100 
 
 		 765 aa  1540    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  47.62 
 
 		 691 aa  626  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  47.38 
 
 		 680 aa  620  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  44.7 
 
 		 678 aa  611  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  43.3 
 
 		 677 aa  588  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  59.18 
 
 		 839 aa  580  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  56.19 
 
 		 832 aa  581  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  40.92 
 
 		 691 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  40.92 
 
 		 691 aa  556  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  40.92 
 
 		 686 aa  556  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  40.92 
 
 		 691 aa  556  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  40.92 
 
 		 686 aa  556  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  40.92 
 
 		 686 aa  556  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  41.8 
 
 		 686 aa  553  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  40.92 
 
 		 686 aa  554  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  40.48 
 
 		 686 aa  553  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3882  AsmA family protein  41.2 
 
 		 686 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3926  AsmA family protein  41.2 
 
 		 686 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3804  AsmA family protein  41.34 
 
 		 686 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3817  AsmA family protein  41.2 
 
 		 686 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3985  AsmA family protein  41.2 
 
 		 686 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189734 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  39.26 
 
 		 739 aa  529  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  56.05 
 
 		 824 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  39.35 
 
 		 729 aa  528  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  55.84 
 
 		 830 aa  525  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  55.84 
 
 		 830 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  55.32 
 
 		 818 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  55.84 
 
 		 830 aa  525  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  55.84 
 
 		 830 aa  525  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  55.84 
 
 		 830 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  55.84 
 
 		 830 aa  525  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  38.82 
 
 		 745 aa  525  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  34.61 
 
 		 669 aa  421  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  34.81 
 
 		 632 aa  409  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  38.6 
 
 		 762 aa  409  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  38.28 
 
 		 761 aa  376  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  36.31 
 
 		 791 aa  360  6e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  29.81 
 
 		 667 aa  346  8.999999999999999e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  30.25 
 
 		 670 aa  318  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  34.08 
 
 		 657 aa  317  7e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  31.23 
 
 		 664 aa  312  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  30.76 
 
 		 669 aa  310  9e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  30.3 
 
 		 656 aa  288  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  30.46 
 
 		 697 aa  283  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  27.57 
 
 		 649 aa  246  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2433  AsmA family protein  26.38 
 
 		 710 aa  203  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2026  normal  0.914727 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2665  AsmA family protein  26.98 
 
 		 674 aa  201  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  52.73 
 
 		 810 aa  200  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  48.94 
 
 		 759 aa  196  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  42.62 
 
 		 765 aa  190  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  42.62 
 
 		 765 aa  190  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  47.87 
 
 		 764 aa  190  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  42.92 
 
 		 765 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  42.99 
 
 		 765 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  43.72 
 
 		 765 aa  180  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  26.97 
 
 		 700 aa  153  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  25.93 
 
 		 704 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0489  hypothetical protein  21.1 
 
 		 665 aa  93.6  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000190696  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01675  AsmA family membrane protein  26.23 
 
 		 342 aa  70.5  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3424  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  28.12 
 
 		 1077 aa  65.5  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  23.9 
 
 		 737 aa  64.7  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  25.26 
 
 		 1061 aa  63.9  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  21.92 
 
 		 895 aa  64.3  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  23.84 
 
 		 587 aa  63.9  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1745  hypothetical protein  26.92 
 
 		 482 aa  63.2  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  27.75 
 
 		 1061 aa  59.3  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  21.51 
 
 		 677 aa  55.5  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  24.19 
 
 		 794 aa  53.9  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  29.6 
 
 		 612 aa  52  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  26.21 
 
 		 797 aa  51.2  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  23.24 
 
 		 695 aa  50.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  23.31 
 
 		 1094 aa  50.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  24.65 
 
 		 604 aa  49.3  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  22.31 
 
 		 711 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  27.89 
 
 		 1146 aa  48.9  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  24.65 
 
 		 508 aa  49.3  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  24.65 
 
 		 502 aa  49.3  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  23.86 
 
 		 1278 aa  48.5  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  21.91 
 
 		 812 aa  48.5  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  25 
 
 		 606 aa  48.1  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  25 
 
 		 725 aa  47.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  25.95 
 
 		 712 aa  47.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  26.67 
 
 		 660 aa  46.6  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1371  AsmA family protein  26.8 
 
 		 1104 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000870938  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  25.33 
 
 		 607 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  23.3 
 
 		 695 aa  46.2  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>