91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2433 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2433  AsmA family protein  100 
 
 		 710 aa  1426    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2026  normal  0.914727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  29.68 
 
 		 649 aa  255  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  27.82 
 
 		 632 aa  233  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  28.64 
 
 		 657 aa  228  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  26.37 
 
 		 669 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  27.18 
 
 		 688 aa  218  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  25.3 
 
 		 667 aa  218  4e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  27.05 
 
 		 688 aa  217  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  26.13 
 
 		 765 aa  204  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  26.19 
 
 		 670 aa  203  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  25.94 
 
 		 765 aa  203  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  26.87 
 
 		 669 aa  199  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  26.15 
 
 		 740 aa  197  8.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  26.23 
 
 		 664 aa  194  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  27.26 
 
 		 689 aa  191  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  26.26 
 
 		 689 aa  190  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  30.02 
 
 		 735 aa  188  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  27.52 
 
 		 688 aa  187  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  25.66 
 
 		 688 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  25.75 
 
 		 688 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  24.6 
 
 		 677 aa  182  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  25.75 
 
 		 688 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  24.88 
 
 		 656 aa  180  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  27.08 
 
 		 680 aa  179  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  26.14 
 
 		 669 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2665  AsmA family protein  25.11 
 
 		 674 aa  171  5e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  25 
 
 		 678 aa  170  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  28.31 
 
 		 791 aa  167  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  25.44 
 
 		 691 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  27.15 
 
 		 810 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  26.18 
 
 		 761 aa  156  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  27.23 
 
 		 839 aa  148  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  24.59 
 
 		 782 aa  148  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  27.02 
 
 		 759 aa  147  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  26.45 
 
 		 830 aa  147  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  26.45 
 
 		 830 aa  147  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  26.45 
 
 		 830 aa  147  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  26.45 
 
 		 830 aa  147  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  26.45 
 
 		 830 aa  147  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  26.45 
 
 		 830 aa  147  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  26.45 
 
 		 824 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  26.71 
 
 		 765 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  27.1 
 
 		 832 aa  145  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  23.45 
 
 		 686 aa  145  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  23.16 
 
 		 686 aa  144  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  25.52 
 
 		 762 aa  144  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  26.57 
 
 		 765 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  23.3 
 
 		 686 aa  144  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  23.3 
 
 		 686 aa  144  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  23.16 
 
 		 691 aa  144  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  23.16 
 
 		 691 aa  144  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  23.16 
 
 		 691 aa  144  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  23.3 
 
 		 686 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  26.15 
 
 		 818 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  25.87 
 
 		 764 aa  140  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3804  AsmA family protein  24.59 
 
 		 686 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  26.72 
 
 		 765 aa  140  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3882  AsmA family protein  24.32 
 
 		 686 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  26.72 
 
 		 765 aa  140  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3926  AsmA family protein  24.32 
 
 		 686 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  26.72 
 
 		 765 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3985  AsmA family protein  24.32 
 
 		 686 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189734 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  26.92 
 
 		 729 aa  140  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3817  AsmA family protein  24.16 
 
 		 686 aa  139  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  26.92 
 
 		 745 aa  138  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  24.54 
 
 		 791 aa  139  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  26.92 
 
 		 739 aa  138  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  25.28 
 
 		 697 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  24.22 
 
 		 700 aa  115  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  23.63 
 
 		 686 aa  114  9e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  21.01 
 
 		 704 aa  99.8  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  21.05 
 
 		 895 aa  67  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  30.89 
 
 		 587 aa  54.7  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  23.85 
 
 		 748 aa  53.9  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  21.93 
 
 		 695 aa  50.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0489  hypothetical protein  19.32 
 
 		 665 aa  49.3  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000190696  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  21.1 
 
 		 606 aa  48.9  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  23.46 
 
 		 660 aa  48.9  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  23.46 
 
 		 660 aa  48.9  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01675  AsmA family membrane protein  22.82 
 
 		 342 aa  48.1  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3424  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  22.66 
 
 		 1061 aa  48.1  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  20.38 
 
 		 1094 aa  47  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  23.64 
 
 		 604 aa  47.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  24.85 
 
 		 607 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  24.85 
 
 		 607 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  24.85 
 
 		 607 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  24.85 
 
 		 607 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  25.93 
 
 		 737 aa  45.4  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  20.65 
 
 		 1061 aa  45.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  21.84 
 
 		 606 aa  44.7  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  21.84 
 
 		 606 aa  44.3  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>