175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2769 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  100 
 
 		 587 aa  1144    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  25.51 
 
 		 609 aa  137  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  36.18 
 
 		 677 aa  98.2  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  27.67 
 
 		 632 aa  97.4  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1137  AsmA family protein  26.29 
 
 		 265 aa  95.1  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0909358 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  31.79 
 
 		 704 aa  95.1  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  29.21 
 
 		 664 aa  88.6  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  30.21 
 
 		 649 aa  88.6  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  28.1 
 
 		 670 aa  86.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  33.18 
 
 		 1077 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  20.95 
 
 		 656 aa  82.4  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  29 
 
 		 667 aa  79.7  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  24.25 
 
 		 688 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  25.74 
 
 		 657 aa  79  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  22.57 
 
 		 640 aa  77.4  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  23.95 
 
 		 688 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  27.64 
 
 		 669 aa  74.7  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  30.64 
 
 		 794 aa  74.7  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  28.86 
 
 		 895 aa  74.7  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  25.3 
 
 		 735 aa  74.7  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  23.02 
 
 		 700 aa  73.9  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  24.38 
 
 		 678 aa  73.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  26.38 
 
 		 669 aa  73.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  35.4 
 
 		 737 aa  72.8  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  26.71 
 
 		 765 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  30.16 
 
 		 789 aa  71.2  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  26.47 
 
 		 791 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  30.77 
 
 		 839 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  28.37 
 
 		 740 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  24.86 
 
 		 677 aa  69.3  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  23.16 
 
 		 686 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  25.41 
 
 		 761 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  26.42 
 
 		 762 aa  68.9  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0491  AsmA family protein  30.26 
 
 		 818 aa  68.2  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487855 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  31.29 
 
 		 742 aa  68.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  27.53 
 
 		 797 aa  67.8  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  25.75 
 
 		 765 aa  67.8  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  26.64 
 
 		 893 aa  67.4  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  22.79 
 
 		 686 aa  67.4  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  23.6 
 
 		 686 aa  67  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  22.79 
 
 		 686 aa  67  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  22.79 
 
 		 686 aa  67  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  29.23 
 
 		 832 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  22.79 
 
 		 691 aa  67  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  22.79 
 
 		 691 aa  67  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  22.79 
 
 		 691 aa  67  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  23.03 
 
 		 691 aa  67  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  22.79 
 
 		 686 aa  67  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  25.35 
 
 		 695 aa  65.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  29.08 
 
 		 660 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  24.71 
 
 		 689 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  23.28 
 
 		 688 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  29.69 
 
 		 810 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  22.32 
 
 		 607 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  24.71 
 
 		 689 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  27.68 
 
 		 611 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  20.14 
 
 		 502 aa  65.5  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  20.14 
 
 		 508 aa  65.1  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  27.43 
 
 		 675 aa  65.1  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  29.34 
 
 		 607 aa  64.7  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  29.34 
 
 		 607 aa  64.7  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  23.95 
 
 		 759 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  32 
 
 		 762 aa  64.3  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  28.69 
 
 		 660 aa  64.3  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2433  AsmA family protein  30.89 
 
 		 710 aa  64.3  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2026  normal  0.914727 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3817  AsmA family protein  22.59 
 
 		 686 aa  63.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3804  AsmA family protein  22.59 
 
 		 686 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3926  AsmA family protein  22.59 
 
 		 686 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3985  AsmA family protein  22.59 
 
 		 686 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189734 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  32.9 
 
 		 699 aa  63.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  29.34 
 
 		 607 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  28.06 
 
 		 695 aa  63.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3882  AsmA family protein  22.59 
 
 		 686 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0489  hypothetical protein  23.74 
 
 		 665 aa  62.4  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000190696  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  27.04 
 
 		 709 aa  62.4  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  29.1 
 
 		 606 aa  62.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  31.05 
 
 		 725 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  28.06 
 
 		 765 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  28.06 
 
 		 765 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  28.06 
 
 		 765 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  27.34 
 
 		 764 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  30.77 
 
 		 830 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  30.77 
 
 		 830 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  25.82 
 
 		 646 aa  60.8  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  30.77 
 
 		 830 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  30.77 
 
 		 830 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  30.77 
 
 		 830 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  30.77 
 
 		 830 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  30.77 
 
 		 824 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  23.81 
 
 		 782 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  28.22 
 
 		 604 aa  59.7  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3175  AsmA family protein  31.44 
 
 		 741 aa  60.1  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  25.67 
 
 		 745 aa  60.1  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  23.36 
 
 		 669 aa  60.1  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  29.37 
 
 		 818 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  24.6 
 
 		 606 aa  58.9  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  23.41 
 
 		 688 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  32.21 
 
 		 812 aa  58.2  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  21.49 
 
 		 614 aa  58.5  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  31.85 
 
 		 712 aa  58.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>