109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0560 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  100 
 
 		 705 aa  1379    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  47.36 
 
 		 640 aa  554  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  47 
 
 		 655 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  44.23 
 
 		 649 aa  542  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  45.08 
 
 		 649 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  47.14 
 
 		 602 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  31.46 
 
 		 677 aa  184  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  27.85 
 
 		 599 aa  178  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  29.61 
 
 		 611 aa  165  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  32.09 
 
 		 1013 aa  159  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  32.39 
 
 		 709 aa  145  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  34.1 
 
 		 675 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  24.58 
 
 		 604 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  24.41 
 
 		 607 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  31.13 
 
 		 660 aa  127  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  31.13 
 
 		 660 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  22.8 
 
 		 695 aa  124  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  24.41 
 
 		 607 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  24.24 
 
 		 607 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  24.05 
 
 		 614 aa  118  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  25.04 
 
 		 606 aa  115  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  24.73 
 
 		 606 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  24.96 
 
 		 611 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  25.54 
 
 		 606 aa  114  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  24.73 
 
 		 612 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  24.96 
 
 		 607 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  23.87 
 
 		 606 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  24.78 
 
 		 608 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  23.94 
 
 		 606 aa  110  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  27.15 
 
 		 893 aa  109  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  24.5 
 
 		 719 aa  109  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  24.16 
 
 		 606 aa  108  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  24.87 
 
 		 656 aa  106  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  28.61 
 
 		 703 aa  104  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  31.76 
 
 		 742 aa  103  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  25.41 
 
 		 655 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  27.42 
 
 		 695 aa  103  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  28.35 
 
 		 656 aa  103  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  23.49 
 
 		 614 aa  101  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  29.46 
 
 		 699 aa  100  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  29.57 
 
 		 654 aa  100  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  27.53 
 
 		 712 aa  98.2  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  27.95 
 
 		 649 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  28.74 
 
 		 648 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  28.17 
 
 		 812 aa  95.9  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  27.95 
 
 		 643 aa  94  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  29.62 
 
 		 682 aa  93.6  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  27.67 
 
 		 645 aa  92.8  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  28.57 
 
 		 826 aa  84.7  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  23.55 
 
 		 646 aa  83.2  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  26.23 
 
 		 797 aa  82  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  25.6 
 
 		 640 aa  79  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  23.41 
 
 		 696 aa  78.6  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2451  putative assembly protein  22.9 
 
 		 618 aa  76.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3193  putative assembly protein  22.9 
 
 		 618 aa  76.6  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182103  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2550  putative assembly protein  22.9 
 
 		 618 aa  76.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208031  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3300  AsmA family protein  21.75 
 
 		 642 aa  68.6  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102048 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  26.29 
 
 		 732 aa  66.6  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1578  putative assembly protein  20.68 
 
 		 611 aa  66.6  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.976931  normal  0.530891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3762  AsmA family protein  22.18 
 
 		 654 aa  63.9  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  26.49 
 
 		 701 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  23.08 
 
 		 617 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  23.08 
 
 		 617 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1291  putative assembly protein  22.49 
 
 		 611 aa  61.2  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  23.08 
 
 		 617 aa  60.8  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2357  putative assembly protein  23.08 
 
 		 617 aa  60.8  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  23.08 
 
 		 617 aa  60.8  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0996  putative assembly protein  22.91 
 
 		 617 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1168  putative assembly protein  22.91 
 
 		 617 aa  59.7  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2204  putative assembly protein  22.6 
 
 		 617 aa  58.9  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3040  putative assembly protein  22.15 
 
 		 611 aa  59.3  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3001  putative assembly protein  23.08 
 
 		 617 aa  58.5  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.352254 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  25.13 
 
 		 508 aa  57.4  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  22.96 
 
 		 502 aa  57.4  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  24.91 
 
 		 741 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3365  AsmA family protein  20.42 
 
 		 655 aa  50.8  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.590521 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3175  AsmA family protein  31.46 
 
 		 741 aa  50.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0379  AsmA family protein  25.42 
 
 		 630 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0432846  hitchhiker  0.00179462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0411  AsmA family protein  24.14 
 
 		 630 aa  50.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0513288  hitchhiker  0.0000211549 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  23.69 
 
 		 1080 aa  49.3  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  25.85 
 
 		 711 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  26.92 
 
 		 761 aa  48.9  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  25.2 
 
 		 725 aa  48.5  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2869  putative assembly protein  22.12 
 
 		 604 aa  48.5  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  25.11 
 
 		 740 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5855  AsmA family protein  27.18 
 
 		 580 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2247  putative assembly protein  21.09 
 
 		 618 aa  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  24.01 
 
 		 741 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2461  putative assembly protein  21.67 
 
 		 618 aa  48.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.45795 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2303  putative assembly protein  21.67 
 
 		 618 aa  47.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  26.01 
 
 		 747 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  21.43 
 
 		 762 aa  47.4  0.0009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  27.78 
 
 		 789 aa  46.6  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  21.38 
 
 		 794 aa  46.6  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  31.03 
 
 		 748 aa  47  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2354  putative assembly protein  21.09 
 
 		 618 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.827623  normal  0.53573 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2678  putative assembly protein  21.55 
 
 		 615 aa  46.2  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.462778  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  21.29 
 
 		 745 aa  46.2  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2347  putative assembly protein  21.26 
 
 		 618 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1199  putative assembly protein  21.89 
 
 		 599 aa  46.6  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>