56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3300 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3300  AsmA family protein  100 
 
 		 642 aa  1276    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102048 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3365  AsmA family protein  46.39 
 
 		 655 aa  545  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.590521 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  27.17 
 
 		 656 aa  177  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  27.95 
 
 		 645 aa  173  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  25.67 
 
 		 643 aa  172  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  27.13 
 
 		 649 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2918  AsmA family protein  27.56 
 
 		 632 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0271811  normal  0.516066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3144  AsmA family protein  27.51 
 
 		 632 aa  161  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524402  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3762  AsmA family protein  25.61 
 
 		 654 aa  158  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  25.97 
 
 		 654 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  25.33 
 
 		 648 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3042  AsmA family protein  25.91 
 
 		 634 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  24.76 
 
 		 655 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6363  AsmA family protein  28.3 
 
 		 611 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188409  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  21.65 
 
 		 677 aa  106  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3924  AsmA family protein  20.48 
 
 		 649 aa  105  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5855  AsmA family protein  28.64 
 
 		 580 aa  103  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1552  AsmA family protein  22.74 
 
 		 645 aa  103  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5002  AsmA family protein  26.61 
 
 		 610 aa  102  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600572 
 
 
-
 
NC_004310  BR1608  AsmA family protein  22.52 
 
 		 645 aa  99.8  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0438435  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0167  AsmA  22.63 
 
 		 603 aa  94.7  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0314  AsmA family protein  23.59 
 
 		 608 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0411  AsmA family protein  21.6 
 
 		 630 aa  81.6  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0513288  hitchhiker  0.0000211549 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  21.57 
 
 		 709 aa  80.9  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0379  AsmA family protein  21.07 
 
 		 630 aa  79.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0432846  hitchhiker  0.00179462 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  25.65 
 
 		 656 aa  73.9  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  20.98 
 
 		 705 aa  69.7  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0826  AsmA family protein  20.53 
 
 		 651 aa  67.4  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  24.61 
 
 		 1077 aa  58.5  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  20.53 
 
 		 649 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  26.25 
 
 		 655 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0705  hypothetical protein  24.12 
 
 		 1174 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  21.27 
 
 		 640 aa  54.7  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  22.99 
 
 		 649 aa  53.9  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  23.3 
 
 		 677 aa  53.5  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  20.06 
 
 		 761 aa  53.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  23.4 
 
 		 689 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  21.87 
 
 		 656 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  22.37 
 
 		 632 aa  50.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  21.94 
 
 		 682 aa  49.3  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0298  AsmA family protein  19.15 
 
 		 626 aa  48.1  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  28.48 
 
 		 611 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2059  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1210 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.888288  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  22.44 
 
 		 689 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  23.28 
 
 		 735 aa  46.2  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1421  AsmA family protein  32.77 
 
 		 1331 aa  46.2  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.492476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  28.19 
 
 		 599 aa  45.8  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  22.32 
 
 		 797 aa  45.4  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  20.98 
 
 		 791 aa  45.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  22.84 
 
 		 695 aa  45.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  22.12 
 
 		 602 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3857  AsmA  28.03 
 
 		 862 aa  44.3  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  22.92 
 
 		 791 aa  44.3  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  26.61 
 
 		 812 aa  44.3  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  23.35 
 
 		 703 aa  43.9  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  21.12 
 
 		 640 aa  43.9  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>