41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3144 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2918  AsmA family protein  98.1 
 
 		 632 aa  1186    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0271811  normal  0.516066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3144  AsmA family protein  100 
 
 		 632 aa  1209    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524402  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3042  AsmA family protein  86.54 
 
 		 634 aa  1000    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5002  AsmA family protein  42.46 
 
 		 610 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6363  AsmA family protein  40.66 
 
 		 611 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188409  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5855  AsmA family protein  38.73 
 
 		 580 aa  280  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3300  AsmA family protein  27.51 
 
 		 642 aa  160  8e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102048 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3365  AsmA family protein  28.19 
 
 		 655 aa  150  8e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.590521 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  28.49 
 
 		 656 aa  147  5e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  28.28 
 
 		 645 aa  146  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  26.69 
 
 		 655 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  27.66 
 
 		 643 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  27.91 
 
 		 648 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  28.31 
 
 		 654 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  29.57 
 
 		 649 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3762  AsmA family protein  27.26 
 
 		 654 aa  124  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1552  AsmA family protein  24.84 
 
 		 645 aa  97.8  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3924  AsmA family protein  24.06 
 
 		 649 aa  95.5  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1608  AsmA family protein  24.4 
 
 		 645 aa  90.1  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0438435  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0167  AsmA  25.19 
 
 		 603 aa  87  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0298  AsmA family protein  21.01 
 
 		 626 aa  66.6  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  21.43 
 
 		 677 aa  62.4  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  27.22 
 
 		 660 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  26.58 
 
 		 791 aa  58.9  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0826  AsmA family protein  23.04 
 
 		 651 aa  58.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  26.9 
 
 		 660 aa  57.4  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0314  AsmA family protein  27.14 
 
 		 608 aa  57  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  30.15 
 
 		 611 aa  54.7  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0379  AsmA family protein  23.28 
 
 		 630 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0432846  hitchhiker  0.00179462 
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1247 aa  49.7  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0411  AsmA family protein  22.57 
 
 		 630 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0513288  hitchhiker  0.0000211549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  28.81 
 
 		 599 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  25.21 
 
 		 675 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1365  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1247 aa  50.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  25.37 
 
 		 832 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  25.84 
 
 		 1013 aa  48.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  27.46 
 
 		 1278 aa  48.5  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  25 
 
 		 839 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  22.77 
 
 		 712 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  19.05 
 
 		 695 aa  46.2  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  26.47 
 
 		 810 aa  45.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>