57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3365 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3365  AsmA family protein  100 
 
 		 655 aa  1301    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.590521 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3300  AsmA family protein  46.39 
 
 		 642 aa  530  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102048 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  27.12 
 
 		 656 aa  206  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  26.41 
 
 		 643 aa  197  6e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  27.02 
 
 		 648 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3762  AsmA family protein  28.2 
 
 		 654 aa  191  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  26.77 
 
 		 655 aa  190  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  25.25 
 
 		 645 aa  181  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  26.79 
 
 		 654 aa  180  9e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  28.04 
 
 		 649 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3042  AsmA family protein  28.01 
 
 		 634 aa  146  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3144  AsmA family protein  27.76 
 
 		 632 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524402  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2918  AsmA family protein  27.92 
 
 		 632 aa  137  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0271811  normal  0.516066 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5855  AsmA family protein  28.39 
 
 		 580 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  22.39 
 
 		 677 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6363  AsmA family protein  26.74 
 
 		 611 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188409  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1552  AsmA family protein  21.99 
 
 		 645 aa  107  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0167  AsmA  26.33 
 
 		 603 aa  105  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3924  AsmA family protein  22.61 
 
 		 649 aa  104  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5002  AsmA family protein  27.72 
 
 		 610 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600572 
 
 
-
 
NC_004310  BR1608  AsmA family protein  21.84 
 
 		 645 aa  102  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0438435  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0826  AsmA family protein  26.71 
 
 		 651 aa  99.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  22.91 
 
 		 709 aa  90.9  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0411  AsmA family protein  22.08 
 
 		 630 aa  82.8  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0513288  hitchhiker  0.0000211549 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0379  AsmA family protein  22.16 
 
 		 630 aa  74.7  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0432846  hitchhiker  0.00179462 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  25.45 
 
 		 660 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  23.32 
 
 		 699 aa  68.2  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  25.27 
 
 		 660 aa  67.4  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  23.05 
 
 		 682 aa  65.1  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0298  AsmA family protein  20.93 
 
 		 626 aa  64.3  0.000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  21.35 
 
 		 640 aa  61.2  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  23.96 
 
 		 675 aa  61.2  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  22.64 
 
 		 649 aa  60.8  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  24.84 
 
 		 656 aa  58.2  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  26.65 
 
 		 649 aa  57.4  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  20.78 
 
 		 797 aa  54.3  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0314  AsmA family protein  26.62 
 
 		 608 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.39732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  20.65 
 
 		 695 aa  50.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  24.2 
 
 		 655 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  27.75 
 
 		 826 aa  49.3  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  28.44 
 
 		 696 aa  49.3  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  19.13 
 
 		 712 aa  49.3  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  22.84 
 
 		 782 aa  48.1  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  22.51 
 
 		 612 aa  46.6  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  20.51 
 
 		 705 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  26.34 
 
 		 677 aa  46.2  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  20.47 
 
 		 762 aa  45.4  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  21.44 
 
 		 732 aa  45.4  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  21.63 
 
 		 695 aa  45.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  20.55 
 
 		 614 aa  45.4  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  22.32 
 
 		 1013 aa  45.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  24.56 
 
 		 701 aa  45.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0596  AsmA family protein  28.45 
 
 		 1186 aa  45.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233427 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  18.83 
 
 		 703 aa  44.7  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  24.79 
 
 		 742 aa  44.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  26.13 
 
 		 765 aa  44.3  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  25 
 
 		 587 aa  43.9  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>