27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0705 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0705  hypothetical protein  100 
 
 		 1174 aa  2199    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0365  hypothetical protein  46.99 
 
 		 1175 aa  758    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0396  hypothetical protein  47.24 
 
 		 1179 aa  772    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.568269  normal  0.674287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2059  hypothetical protein  76.77 
 
 		 1210 aa  1593    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.888288  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4952  hypothetical protein  50.76 
 
 		 1146 aa  872    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000122886 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0320  hypothetical protein  47.08 
 
 		 1175 aa  756    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2806  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1238 aa  153  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2547  hypothetical protein  22.98 
 
 		 1234 aa  142  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00977627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2828  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1230 aa  141  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2030  hypothetical protein  24.12 
 
 		 1246 aa  137  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0479736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0596  AsmA family protein  30.39 
 
 		 1186 aa  99.8  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233427 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2736  hypothetical protein  28.02 
 
 		 1275 aa  88.2  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758351  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  27.7 
 
 		 1278 aa  86.3  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1365  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1247 aa  82.4  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1247 aa  82.4  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3274  AsmA  28.4 
 
 		 1239 aa  79.7  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.564175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1984  AsmA  28.16 
 
 		 1273 aa  75.5  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1421  AsmA family protein  26.27 
 
 		 1331 aa  73.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.492476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  24.93 
 
 		 1146 aa  72.8  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  26.08 
 
 		 1077 aa  65.5  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3300  AsmA family protein  24.12 
 
 		 642 aa  55.5  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102048 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6121  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1258 aa  53.5  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4017  AsmA family protein  28.54 
 
 		 1274 aa  51.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43483  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3363  AsmA  27.1 
 
 		 1308 aa  47  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210468 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  30.07 
 
 		 649 aa  47.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  26.36 
 
 		 331 aa  46.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0756  putative ribosomal protein L5-like protein  36 
 
 		 359 aa  44.7  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0450943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>