25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0396 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0396  hypothetical protein  100 
 
 		 1179 aa  2189    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.568269  normal  0.674287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2059  hypothetical protein  47.34 
 
 		 1210 aa  808    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.888288  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0705  hypothetical protein  48.2 
 
 		 1174 aa  855    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4952  hypothetical protein  53.94 
 
 		 1146 aa  958    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000122886 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0320  hypothetical protein  86.61 
 
 		 1175 aa  1725    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0365  hypothetical protein  86.44 
 
 		 1175 aa  1721    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0596  AsmA family protein  28 
 
 		 1186 aa  165  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233427 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2030  hypothetical protein  25.77 
 
 		 1246 aa  158  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0479736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2547  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1234 aa  158  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00977627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2828  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1230 aa  134  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2806  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1238 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1247 aa  111  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1365  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1247 aa  110  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  29.05 
 
 		 1278 aa  105  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1984  AsmA  25.84 
 
 		 1273 aa  100  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697769  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2736  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1275 aa  80.9  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758351  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1421  AsmA family protein  30.4 
 
 		 1331 aa  76.3  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.492476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4017  AsmA family protein  29.24 
 
 		 1274 aa  68.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43483  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2027  AsmA  29.23 
 
 		 1273 aa  66.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal  0.201776 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  34.71 
 
 		 1146 aa  63.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3363  AsmA  28.7 
 
 		 1308 aa  61.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6121  hypothetical protein  26.77 
 
 		 1258 aa  59.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3274  AsmA  29.72 
 
 		 1239 aa  53.5  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.564175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  31.3 
 
 		 1077 aa  49.3  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0084  hypothetical protein  32 
 
 		 999 aa  47  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>