41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2030 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2806  hypothetical protein  50.51 
 
 		 1238 aa  1149    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2828  hypothetical protein  42.7 
 
 		 1230 aa  881    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2547  hypothetical protein  50.17 
 
 		 1234 aa  1141    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00977627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2030  hypothetical protein  100 
 
 		 1246 aa  2470    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0479736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1984  AsmA  34.21 
 
 		 1273 aa  571  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1365  hypothetical protein  33 
 
 		 1247 aa  541  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  32.81 
 
 		 1247 aa  538  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  32.11 
 
 		 1278 aa  536  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1421  AsmA family protein  25.43 
 
 		 1331 aa  189  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.492476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2059  hypothetical protein  25.06 
 
 		 1210 aa  154  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.888288  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6121  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1258 aa  142  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2027  AsmA  25.11 
 
 		 1273 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal  0.201776 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  24.32 
 
 		 1146 aa  135  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0705  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1174 aa  135  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4952  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1146 aa  134  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000122886 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2736  hypothetical protein  23.97 
 
 		 1275 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758351  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3363  AsmA  25.3 
 
 		 1308 aa  117  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4017  AsmA family protein  25.59 
 
 		 1274 aa  112  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43483  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3274  AsmA  26.05 
 
 		 1239 aa  108  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.564175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0396  hypothetical protein  26.04 
 
 		 1179 aa  91.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.568269  normal  0.674287 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0596  AsmA family protein  25.67 
 
 		 1186 aa  90.5  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233427 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  23.29 
 
 		 1077 aa  86.3  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0320  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1175 aa  71.6  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0365  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1175 aa  70.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  25.11 
 
 		 643 aa  65.9  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  25.1 
 
 		 648 aa  57.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  23.63 
 
 		 632 aa  56.2  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  24.51 
 
 		 656 aa  54.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0084  hypothetical protein  26.79 
 
 		 999 aa  52.8  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  25.89 
 
 		 654 aa  52.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  25.85 
 
 		 649 aa  52  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  23.56 
 
 		 649 aa  51.6  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  19.39 
 
 		 667 aa  51.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  24.67 
 
 		 645 aa  50.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0379  AsmA family protein  25.59 
 
 		 630 aa  50.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0432846  hitchhiker  0.00179462 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  23.48 
 
 		 696 aa  50.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  24.11 
 
 		 655 aa  50.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0826  AsmA family protein  22.64 
 
 		 651 aa  47.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  20.47 
 
 		 688 aa  48.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  20.71 
 
 		 740 aa  45.1  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  22.92 
 
 		 709 aa  45.1  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>