37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2828 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2806  hypothetical protein  46.11 
 
 		 1238 aa  1001    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2828  hypothetical protein  100 
 
 		 1230 aa  2425    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2547  hypothetical protein  46.02 
 
 		 1234 aa  1003    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00977627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2030  hypothetical protein  42.75 
 
 		 1246 aa  905    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0479736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1984  AsmA  34.01 
 
 		 1273 aa  591  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1365  hypothetical protein  30.93 
 
 		 1247 aa  486  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  30.85 
 
 		 1247 aa  480  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  30.71 
 
 		 1278 aa  477  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6121  hypothetical protein  24.26 
 
 		 1258 aa  175  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4017  AsmA family protein  24.83 
 
 		 1274 aa  164  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43483  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0705  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1174 aa  155  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1421  AsmA family protein  24.43 
 
 		 1331 aa  149  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.492476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  24.71 
 
 		 1146 aa  142  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2059  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1210 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.888288  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2736  hypothetical protein  26.53 
 
 		 1275 aa  137  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758351  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2027  AsmA  23.8 
 
 		 1273 aa  110  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal  0.201776 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3274  AsmA  26.85 
 
 		 1239 aa  107  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.564175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4952  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1146 aa  107  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000122886 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3363  AsmA  23.89 
 
 		 1308 aa  105  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210468 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0596  AsmA family protein  29.97 
 
 		 1186 aa  94.7  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233427 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  23.43 
 
 		 1077 aa  90.5  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0320  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1175 aa  79.7  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0365  hypothetical protein  26.26 
 
 		 1175 aa  80.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0396  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1179 aa  75.9  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.568269  normal  0.674287 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0379  AsmA family protein  25.96 
 
 		 630 aa  63.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0432846  hitchhiker  0.00179462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0411  AsmA family protein  25.48 
 
 		 630 aa  61.6  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0513288  hitchhiker  0.0000211549 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  25.54 
 
 		 646 aa  58.5  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  28.95 
 
 		 696 aa  55.8  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0491  AsmA family protein  26.18 
 
 		 818 aa  51.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  28.77 
 
 		 649 aa  51.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  23.68 
 
 		 655 aa  49.3  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  24.68 
 
 		 895 aa  47.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0826  AsmA family protein  23.15 
 
 		 651 aa  47  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  24.83 
 
 		 677 aa  47  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  23.38 
 
 		 709 aa  46.2  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1214  hypothetical protein  24 
 
 		 928 aa  45.1  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  25 
 
 		 632 aa  44.7  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>