13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1090 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1887  hypothetical protein  60.68 
 
 
849 aa  959    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1090  hypothetical protein  100 
 
 
821 aa  1600    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.665331  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1133  hypothetical protein  35.81 
 
 
856 aa  435  1e-120  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0928  hypothetical protein  37.76 
 
 
655 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.903286  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1400  hypothetical protein  31.41 
 
 
843 aa  379  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.71275  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0555  hypothetical protein  31.17 
 
 
843 aa  374  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0634  hypothetical protein  30.93 
 
 
856 aa  370  1e-101  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0819  hypothetical protein  30.47 
 
 
856 aa  318  3e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1091  hypothetical protein  27.57 
 
 
853 aa  281  5e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1045  hypothetical protein  27.49 
 
 
921 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.665952  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1861  membrane protein-like protein  26.87 
 
 
1144 aa  49.7  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.777283  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  27.33 
 
 
1094 aa  47.8  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  23.65 
 
 
1079 aa  45.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>