23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04855 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04855  outer membrane assembly protein  100 
 
 		 884 aa  1748    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1716  AsmA family protein  44.09 
 
 		 867 aa  702    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2110  hypothetical protein  38.32 
 
 		 892 aa  598  1e-169  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1971  AsmA family protein  28.21 
 
 		 892 aa  401  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457681  normal  0.0391828 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0930  hypothetical protein  26.48 
 
 		 911 aa  325  2e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.910887 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1214  hypothetical protein  24.78 
 
 		 928 aa  311  5e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0135  membrane spanning protein, required for outer membrane integrity  29.27 
 
 		 1038 aa  212  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.96692  normal  0.0451268 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1832  outer membrane assembly protein  28.67 
 
 		 1031 aa  174  7.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.560991  normal  0.0710344 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1486  hypothetical protein  28.2 
 
 		 1027 aa  155  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1548  AsmA family protein  24.66 
 
 		 919 aa  149  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0338649  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0066  AsmA family protein  24.34 
 
 		 931 aa  136  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.255308  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4317  AsmA family protein  27.16 
 
 		 939 aa  132  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120698  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0208  hypothetical protein  20.37 
 
 		 806 aa  125  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0830445  normal  0.52685 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3185  AsmA family protein  25.25 
 
 		 1090 aa  124  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4539  AsmA family protein  23.28 
 
 		 1031 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392547  hitchhiker  0.00640796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2340  hypothetical protein  22.73 
 
 		 812 aa  71.6  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.129707 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2670  outer membrane related  19.89 
 
 		 791 aa  66.2  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2392  hypothetical protein  18.56 
 
 		 1075 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.299711  normal  0.167741 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2055  hypothetical protein  25.48 
 
 		 587 aa  57.4  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.429866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4024  hypothetical protein  20.94 
 
 		 816 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220512  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4010  hypothetical protein  18.9 
 
 		 832 aa  52.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.865765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0854  AsmA family protein  27.55 
 
 		 715 aa  49.3  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000187162  hitchhiker  0.00000372454 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  21.56 
 
 		 812 aa  44.7  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>