18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0135 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0135  membrane spanning protein, required for outer membrane integrity  100 
 
 		 1038 aa  2087    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.96692  normal  0.0451268 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0066  AsmA family protein  24.66 
 
 		 931 aa  328  4.0000000000000003e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.255308  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1548  AsmA family protein  26.87 
 
 		 919 aa  328  4.0000000000000003e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0338649  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1971  AsmA family protein  40.05 
 
 		 892 aa  318  4e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457681  normal  0.0391828 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4317  AsmA family protein  25.51 
 
 		 939 aa  298  3e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120698  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1832  outer membrane assembly protein  29.15 
 
 		 1031 aa  295  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.560991  normal  0.0710344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4539  AsmA family protein  26.4 
 
 		 1031 aa  229  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.392547  hitchhiker  0.00640796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1486  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1027 aa  228  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04855  outer membrane assembly protein  29.27 
 
 		 884 aa  212  3e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.961437  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1716  AsmA family protein  31.28 
 
 		 867 aa  203  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2110  hypothetical protein  29.15 
 
 		 892 aa  201  7e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3185  AsmA family protein  23.39 
 
 		 1090 aa  199  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0930  hypothetical protein  26.95 
 
 		 911 aa  179  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.910887 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1214  hypothetical protein  26.91 
 
 		 928 aa  161  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0208  hypothetical protein  20.43 
 
 		 806 aa  62  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0830445  normal  0.52685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2055  hypothetical protein  26.51 
 
 		 587 aa  57  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.429866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1342  hypothetical protein  23.08 
 
 		 820 aa  48.5  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.046701  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1421  AsmA family protein  27.2 
 
 		 1331 aa  47  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.492476  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>