More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1388 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1388  glycosyl transferase family 51  100 
 
 
759 aa  1547    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319404  normal  0.452017 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0045  glycosyl transferase family 51  47.27 
 
 
719 aa  678    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.223797 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0829  glycosyl transferase family protein  36.2 
 
 
655 aa  438  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4619  glycosyl transferase family 51  33.06 
 
 
749 aa  160  9e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1238  glycosyl transferase family protein  41.76 
 
 
655 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.368931  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3456  glycosyl transferase family 51  34.44 
 
 
307 aa  144  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0116  transglycosylase  39.02 
 
 
317 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0426  glycosyl transferase family protein  39.89 
 
 
315 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144687  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0062  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.13 
 
 
328 aa  141  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8320699999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0079  glycosyl transferase family 51  39.13 
 
 
319 aa  139  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00663025  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4161  glycosyl transferase family 51  31.44 
 
 
709 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0882638  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2627  glycosyl transferase family 51  32.57 
 
 
656 aa  138  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.987259  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0146  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40.78 
 
 
298 aa  138  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3403  glycosyl transferase family protein  36.48 
 
 
322 aa  137  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2721  glycosyl transferase family 51  40 
 
 
656 aa  137  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4269  glycosyl transferase family protein  40.54 
 
 
317 aa  137  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0170  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40.11 
 
 
303 aa  135  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2529  glycosyl transferase family protein  34.6 
 
 
637 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664539  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2326  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  41.34 
 
 
303 aa  132  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  39.67 
 
 
643 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1979  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40.33 
 
 
275 aa  127  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00123405  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2516  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  42.25 
 
 
236 aa  126  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387388  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  41.78 
 
 
625 aa  126  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  41.78 
 
 
618 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2621  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  42.25 
 
 
246 aa  125  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2700  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  38.55 
 
 
301 aa  125  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240651  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  40.67 
 
 
640 aa  124  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  41.89 
 
 
640 aa  124  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  40 
 
 
654 aa  124  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0540  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  41.55 
 
 
240 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0269  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40 
 
 
230 aa  121  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202831  hitchhiker  0.000723227 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0582  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  39.6 
 
 
245 aa  120  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257138 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0539  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  39.6 
 
 
245 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.593842 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0131  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  39.6 
 
 
245 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.563678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0614  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  39.6 
 
 
245 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3418  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40.14 
 
 
240 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0781618  normal  0.116104 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3696  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  39.6 
 
 
245 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0515  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  39.6 
 
 
245 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  40.41 
 
 
643 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  40.41 
 
 
643 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2444  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  37.75 
 
 
229 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000188115  normal  0.588429 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2771  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  38.26 
 
 
245 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3906  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  39.86 
 
 
231 aa  115  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0819  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  39.38 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.149996 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1903  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  36.62 
 
 
291 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.141884 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1041  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  36.93 
 
 
431 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2458  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  41.38 
 
 
259 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.334512  normal  0.41318 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0231  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  38.99 
 
 
320 aa  110  7.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0539  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40.14 
 
 
230 aa  110  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  35.91 
 
 
761 aa  110  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  40.43 
 
 
778 aa  109  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0959  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  34.29 
 
 
248 aa  108  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.156707  normal  0.22819 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1314  monofunctional peptidoglycan glycosyltransferase, glycosyltransferase family 51 protein  42.25 
 
 
244 aa  107  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.209527 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  33.15 
 
 
741 aa  107  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  38.57 
 
 
905 aa  107  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2011  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  34.64 
 
 
307 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  30.05 
 
 
680 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2288  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  37.21 
 
 
252 aa  106  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02365  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  43.66 
 
 
232 aa  106  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.205981  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  38.5 
 
 
829 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0239  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  37.68 
 
 
247 aa  105  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  35.29 
 
 
743 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2505  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  37.32 
 
 
232 aa  105  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1953  glycosyl transferase family protein  35.56 
 
 
307 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  35.29 
 
 
743 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  35.29 
 
 
743 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  33.12 
 
 
1245 aa  104  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1016  penicillin-binding protein 1A  36.05 
 
 
778 aa  104  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0218  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  39.57 
 
 
245 aa  104  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  38.41 
 
 
765 aa  104  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  39.86 
 
 
795 aa  104  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  37.99 
 
 
750 aa  103  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  35.33 
 
 
712 aa  104  8e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3374  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  42.55 
 
 
274 aa  104  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.296733 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1481  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  37.42 
 
 
238 aa  103  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0317194  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1926  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  34.08 
 
 
307 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.368635  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7388  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  33.69 
 
 
258 aa  103  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  39.86 
 
 
706 aa  103  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0092  1A family penicillin-binding protein  38.3 
 
 
778 aa  103  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000436892  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2806  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  34.3 
 
 
246 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.687279  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1145  peptidoglycan transglycosylase  34.3 
 
 
246 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223409  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2530  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40.69 
 
 
261 aa  103  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3309  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  38.04 
 
 
248 aa  103  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2753  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40 
 
 
261 aa  103  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  42.03 
 
 
681 aa  103  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2776  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  37.69 
 
 
234 aa  103  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.371956 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  35 
 
 
751 aa  102  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  35.5 
 
 
713 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  35.5 
 
 
713 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  35.5 
 
 
713 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3053  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  33.87 
 
 
233 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  36 
 
 
691 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  35.5 
 
 
713 aa  102  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0622  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
231 aa  102  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  35.5 
 
 
713 aa  102  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1172  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  34.69 
 
 
256 aa  102  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  35.5 
 
 
713 aa  102  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3457  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  35.21 
 
 
256 aa  102  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2854  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  35.91 
 
 
252 aa  102  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.720415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3495  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  35.21 
 
 
256 aa  102  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>