29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1899 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6502  protein of unknown function DUF490  29.53 
 
 
1691 aa  806    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1224  hypothetical protein  29.07 
 
 
1650 aa  773    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.934113  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1899  hypothetical protein  100 
 
 
1699 aa  3383    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3195  protein of unknown function DUF490  33.09 
 
 
1644 aa  925    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3471  protein of unknown function DUF490  35.39 
 
 
1712 aa  1096    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0559306 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0734  protein of unknown function DUF490  31.45 
 
 
1690 aa  805    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00643017  unclonable  0.000000000000433323 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03800  hypothetical protein  27.87 
 
 
1686 aa  636  1e-180  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5933  protein of unknown function DUF490  24.34 
 
 
1594 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290241  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3560  protein of unknown function DUF490  23.29 
 
 
1466 aa  293  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.495594 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0160  hypothetical protein  23.15 
 
 
1493 aa  291  6e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3011  hypothetical protein  22.53 
 
 
1532 aa  283  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1956  hypothetical protein  23.84 
 
 
1513 aa  282  4e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3080  protein of unknown function DUF490  22.69 
 
 
1564 aa  273  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.268827 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13133  hypothetical protein  23.13 
 
 
1491 aa  247  9.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4592  hypothetical protein  22.65 
 
 
1494 aa  232  6e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693253  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1460  hypothetical protein  23 
 
 
1446 aa  220  1e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2096  hypothetical protein  21.31 
 
 
1596 aa  213  3e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.351147 
 
 
-
 
NC_002950  PG2094  hypothetical protein  22.04 
 
 
1515 aa  167  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1201  protein of unknown function DUF490  19.79 
 
 
1512 aa  105  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1902  hypothetical protein  18.97 
 
 
1535 aa  70.1  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.427832 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2603  hypothetical protein  21.18 
 
 
1511 aa  60.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2110  hypothetical protein  27.17 
 
 
892 aa  57  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0916  AsmA family protein  22.28 
 
 
767 aa  55.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000782114  hitchhiker  1.05471e-16 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0341  hypothetical protein  21.75 
 
 
1502 aa  50.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  24.33 
 
 
1310 aa  50.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  21.07 
 
 
1224 aa  49.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0345  hypothetical protein  22.57 
 
 
1512 aa  48.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.823577  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4703  hypothetical protein  24.47 
 
 
978 aa  45.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.113752 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2042  protein of unknown function DUF748  17.9 
 
 
1235 aa  45.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>