168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2889 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  94.04 
 
 		 1224 aa  2244    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  66.33 
 
 		 1229 aa  1588    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  66.36 
 
 		 1226 aa  1618    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  57.49 
 
 		 1232 aa  1326    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  68.81 
 
 		 1224 aa  1658    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  87.23 
 
 		 1223 aa  2107    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  63.46 
 
 		 1221 aa  1506    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  40.33 
 
 		 1255 aa  867    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  100 
 
 		 1224 aa  2404    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  60.6 
 
 		 1226 aa  1405    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  94.57 
 
 		 1206 aa  2218    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  62.71 
 
 		 1221 aa  1486    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  30.36 
 
 		 1249 aa  405  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1259 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1259 aa  402  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1259 aa  400  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  27.6 
 
 		 1259 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1259 aa  396  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3963  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1305 aa  388  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3769  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1291 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3624  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1312 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  30.49 
 
 		 1246 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5739  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1259 aa  384  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4700  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1259 aa  385  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  27.44 
 
 		 1259 aa  384  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  27.15 
 
 		 1259 aa  383  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  27 
 
 		 1259 aa  382  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4860  hypothetical protein  27 
 
 		 1259 aa  380  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  27.15 
 
 		 1259 aa  382  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1259 aa  382  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  29.15 
 
 		 1342 aa  372  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  26.99 
 
 		 1258 aa  368  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0460  hypothetical protein  29.08 
 
 		 1256 aa  368  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.524454  normal  0.757907 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  30.46 
 
 		 1340 aa  365  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  31.01 
 
 		 1174 aa  365  2e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  30.19 
 
 		 857 aa  365  3e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  27.57 
 
 		 1254 aa  362  3e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1259 aa  349  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1265 aa  342  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1290 aa  342  4e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1262 aa  336  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  25.9 
 
 		 1254 aa  335  3e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  29.5 
 
 		 1319 aa  329  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  27.76 
 
 		 1290 aa  322  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1297 aa  321  6e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1299 aa  312  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  30.44 
 
 		 1352 aa  303  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  29.52 
 
 		 1305 aa  301  6e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1304 aa  300  9e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  26.89 
 
 		 1344 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1344 aa  297  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1344 aa  296  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1509  hypothetical protein  26.34 
 
 		 1664 aa  295  3e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1319 aa  295  4e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1688  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1664 aa  291  7e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  32.19 
 
 		 1382 aa  290  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1341 aa  281  5e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1606  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1773 aa  277  9e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0503817  hitchhiker  0.0000303134 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1914  hypothetical protein  23.3 
 
 		 1328 aa  275  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.131903  normal  0.0193441 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04025  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1302 aa  262  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  28.68 
 
 		 1385 aa  259  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  28.07 
 
 		 1398 aa  253  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  27.72 
 
 		 1402 aa  251  7e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  27.76 
 
 		 1449 aa  249  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  26.48 
 
 		 1273 aa  246  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  26.41 
 
 		 1273 aa  244  5e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  27.63 
 
 		 1285 aa  243  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1504  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1355 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0340  hypothetical protein  25.77 
 
 		 1174 aa  235  3e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  26.74 
 
 		 1353 aa  235  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  26.89 
 
 		 1243 aa  218  7e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1310 aa  212  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  28.4 
 
 		 1285 aa  200  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  26.3 
 
 		 1025 aa  195  4e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  29.38 
 
 		 1308 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1218 aa  167  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  29.54 
 
 		 1377 aa  158  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  25.61 
 
 		 1184 aa  154  8e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  25.61 
 
 		 1184 aa  154  8e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0607  hypothetical protein  22.17 
 
 		 982 aa  153  2e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  26.31 
 
 		 1325 aa  153  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  30.72 
 
 		 1485 aa  151  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  30.51 
 
 		 1485 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1031  protein of unknown function DUF490  27.33 
 
 		 1426 aa  147  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1401 aa  140  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1770  hypothetical protein  26.77 
 
 		 846 aa  138  5e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  28.02 
 
 		 1359 aa  138  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  27.98 
 
 		 1378 aa  136  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1380 aa  134  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1771  hypothetical protein  26.09 
 
 		 846 aa  132  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  25.19 
 
 		 1304 aa  129  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  30.28 
 
 		 1453 aa  129  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  25.26 
 
 		 1299 aa  124  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1056 aa  122  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  24.98 
 
 		 1346 aa  122  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1443 aa  121  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2443  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1347 aa  119  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2438  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1347 aa  118  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1453 aa  117  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1796  hypothetical protein  31.91 
 
 		 1332 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>