32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6502 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3195  protein of unknown function DUF490  37.02 
 
 		 1644 aa  1128    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3471  protein of unknown function DUF490  27.53 
 
 		 1712 aa  726    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0559306 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6502  protein of unknown function DUF490  100 
 
 		 1691 aa  3405    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1899  hypothetical protein  29.67 
 
 		 1699 aa  800    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0734  protein of unknown function DUF490  26.23 
 
 		 1690 aa  568  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00643017  unclonable  0.000000000000433323 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1224  hypothetical protein  25.16 
 
 		 1650 aa  540  9.999999999999999e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.934113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03800  hypothetical protein  23.25 
 
 		 1686 aa  463  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3560  protein of unknown function DUF490  22.45 
 
 		 1466 aa  233  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.495594 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5933  protein of unknown function DUF490  22.07 
 
 		 1594 aa  228  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13133  hypothetical protein  21.52 
 
 		 1491 aa  224  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3011  hypothetical protein  21.95 
 
 		 1532 aa  197  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0160  hypothetical protein  21.47 
 
 		 1493 aa  188  6e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1956  hypothetical protein  20.44 
 
 		 1513 aa  173  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00140059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3080  protein of unknown function DUF490  25.69 
 
 		 1564 aa  166  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.268827 
 
 
-
 
NC_002950  PG2096  hypothetical protein  23.79 
 
 		 1596 aa  166  3e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.351147 
 
 
-
 
NC_002950  PG2094  hypothetical protein  22.12 
 
 		 1515 aa  149  5e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4592  hypothetical protein  23.27 
 
 		 1494 aa  144  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693253  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1201  protein of unknown function DUF490  22.99 
 
 		 1512 aa  122  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1460  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1446 aa  123  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  29.17 
 
 		 1259 aa  54.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5739  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1259 aa  53.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4860  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1259 aa  54.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4700  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1259 aa  54.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1259 aa  54.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1259 aa  54.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1259 aa  53.9  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1259 aa  53.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5264  protein of unknown function DUF490  24.58 
 
 		 1515 aa  52.4  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0704  protein of unknown function DUF490  22.99 
 
 		 1705 aa  50.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1902  hypothetical protein  24.16 
 
 		 1535 aa  50.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.427832 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1500 aa  47  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2603  hypothetical protein  21.05 
 
 		 1511 aa  45.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>