81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5264 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5264  protein of unknown function DUF490  100 
 
 
1515 aa  2953    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0174  hypothetical protein  28.31 
 
 
1505 aa  152  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0165  hypothetical protein  28.63 
 
 
1504 aa  127  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.615752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0173  protein of unknown function DUF490  27.19 
 
 
1507 aa  127  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0184  protein of unknown function DUF490  26.82 
 
 
1507 aa  124  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  27.59 
 
 
1377 aa  89.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  25.91 
 
 
1372 aa  76.3  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  25.91 
 
 
1372 aa  75.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  25.91 
 
 
1372 aa  75.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  25.91 
 
 
1372 aa  75.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  25.91 
 
 
1372 aa  75.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  25.91 
 
 
1372 aa  75.9  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  25.91 
 
 
1372 aa  75.9  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  28.95 
 
 
1453 aa  74.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  23.08 
 
 
1308 aa  72.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  26.12 
 
 
1434 aa  72.4  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  25.71 
 
 
1375 aa  71.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  23.65 
 
 
1500 aa  69.7  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  22.89 
 
 
1401 aa  69.3  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  25.81 
 
 
1358 aa  68.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  25.81 
 
 
1360 aa  68.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  26.17 
 
 
1451 aa  67.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  22.14 
 
 
1462 aa  63.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  25 
 
 
1346 aa  63.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  23.21 
 
 
1299 aa  63.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  23.91 
 
 
1485 aa  62.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  24.21 
 
 
1485 aa  62.4  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2443  hypothetical protein  24.3 
 
 
1347 aa  62  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295453  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1827  hypothetical protein  24.3 
 
 
1347 aa  62  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2438  hypothetical protein  24.3 
 
 
1347 aa  61.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5769  hypothetical protein  24.13 
 
 
1360 aa  61.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0973726  normal  0.232191 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  22.84 
 
 
1262 aa  60.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  24.07 
 
 
1304 aa  59.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  24.24 
 
 
1435 aa  58.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  25.41 
 
 
1441 aa  58.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4828  hypothetical protein  24.23 
 
 
1392 aa  58.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.470253  normal  0.310225 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  25.55 
 
 
1463 aa  58.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  25.94 
 
 
1392 aa  58.5  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  22.81 
 
 
1325 aa  58.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  24.51 
 
 
1304 aa  57.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  25.99 
 
 
1283 aa  57.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  32.97 
 
 
1550 aa  57.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  23.92 
 
 
1443 aa  56.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  23.66 
 
 
1473 aa  55.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0340  hypothetical protein  20.93 
 
 
1174 aa  55.8  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  23.76 
 
 
1056 aa  55.1  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  27.62 
 
 
1937 aa  55.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  25.66 
 
 
1256 aa  55.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0166  hypothetical protein  25.87 
 
 
1319 aa  54.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  22.28 
 
 
1229 aa  53.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  24.68 
 
 
1359 aa  53.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  24.02 
 
 
1463 aa  53.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  24.5 
 
 
1319 aa  52.8  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  26.92 
 
 
1223 aa  52  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  26.58 
 
 
1530 aa  52  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1103  hypothetical protein  24.78 
 
 
1398 aa  51.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  23.75 
 
 
1255 aa  51.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  26.35 
 
 
1224 aa  50.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0253  protein of unknown function DUF490  20.17 
 
 
1503 aa  51.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3471  protein of unknown function DUF490  25.76 
 
 
1712 aa  51.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0559306 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  27.27 
 
 
1226 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  28.92 
 
 
1221 aa  50.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0367  hypothetical protein  23.61 
 
 
1494 aa  50.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0811995  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  26.69 
 
 
1224 aa  50.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  27.21 
 
 
1783 aa  50.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  28.92 
 
 
1221 aa  49.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  21.29 
 
 
1224 aa  49.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  26.35 
 
 
1206 aa  49.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6502  protein of unknown function DUF490  25.58 
 
 
1691 aa  48.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  21.91 
 
 
1218 aa  48.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1344  hypothetical protein  20.97 
 
 
776 aa  47.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159374 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  28.57 
 
 
1243 aa  47.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  23.05 
 
 
1428 aa  47.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1606  hypothetical protein  21.59 
 
 
1773 aa  47.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0503817  hitchhiker  0.0000303134 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  23.38 
 
 
1382 aa  47  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17710  hypothetical protein  19.96 
 
 
1430 aa  47  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  23.06 
 
 
1448 aa  46.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  22.18 
 
 
1443 aa  45.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  22.97 
 
 
1232 aa  45.1  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  22.17 
 
 
1184 aa  45.1  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  22.17 
 
 
1184 aa  45.1  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>