170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1089 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  100 
 
 		 1434 aa  2730    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  50.27 
 
 		 1453 aa  478  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  36.42 
 
 		 1292 aa  269  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  27.03 
 
 		 1299 aa  261  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  26.13 
 
 		 1304 aa  253  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  26.08 
 
 		 1392 aa  251  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  26.57 
 
 		 1304 aa  250  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  32.34 
 
 		 1346 aa  239  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  30.68 
 
 		 1359 aa  238  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  34.56 
 
 		 1056 aa  236  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  34.64 
 
 		 1243 aa  235  5e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1346 aa  229  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1375 aa  227  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1360 aa  227  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  31.79 
 
 		 1378 aa  223  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1372 aa  220  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  36.9 
 
 		 1473 aa  219  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  26.57 
 
 		 1372 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  26.57 
 
 		 1372 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  26.57 
 
 		 1372 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  26.57 
 
 		 1372 aa  219  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  29.91 
 
 		 1401 aa  218  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1372 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1372 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  31.56 
 
 		 1380 aa  216  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1358 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1448 aa  204  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1827  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1347 aa  204  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2438  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1347 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2443  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1347 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5769  hypothetical protein  27.76 
 
 		 1360 aa  201  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0973726  normal  0.232191 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  32.31 
 
 		 1443 aa  195  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  31.92 
 
 		 1435 aa  192  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  31.21 
 
 		 1218 aa  185  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1796  hypothetical protein  29.14 
 
 		 1332 aa  176  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  26.85 
 
 		 1382 aa  159  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  33 
 
 		 1352 aa  154  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1262 aa  145  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  28.45 
 
 		 1325 aa  144  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  27.55 
 
 		 1308 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  27.94 
 
 		 1319 aa  131  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  29.53 
 
 		 1377 aa  126  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  29.49 
 
 		 1025 aa  125  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1265 aa  125  8e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1232 aa  123  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  27.57 
 
 		 1485 aa  121  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  28.3 
 
 		 1485 aa  121  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  27.77 
 
 		 1285 aa  121  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1290 aa  120  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1223 aa  119  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3963  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1305 aa  118  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1259 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3624  hypothetical protein  26.46 
 
 		 1312 aa  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3769  hypothetical protein  26.46 
 
 		 1291 aa  116  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1254 aa  116  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0340  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1174 aa  115  5e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  27.68 
 
 		 1273 aa  114  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1221 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  27.68 
 
 		 1273 aa  114  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1221 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  25.12 
 
 		 1254 aa  113  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  28.23 
 
 		 1285 aa  112  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1224 aa  111  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1224 aa  111  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1206 aa  110  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  25.92 
 
 		 1226 aa  110  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1226 aa  108  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  30.02 
 
 		 1283 aa  107  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1310 aa  106  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1224 aa  105  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1259 aa  106  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1229 aa  105  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  25.63 
 
 		 1448 aa  105  6e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1319 aa  105  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1259 aa  104  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1259 aa  104  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1259 aa  104  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1259 aa  104  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  26.65 
 
 		 1249 aa  103  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1184 aa  102  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  25.57 
 
 		 1184 aa  102  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0460  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1256 aa  102  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.524454  normal  0.757907 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  28.8 
 
 		 1174 aa  100  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  26.39 
 
 		 1550 aa  100  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1606  hypothetical protein  26.8 
 
 		 1773 aa  100  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0503817  hitchhiker  0.0000303134 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  23.57 
 
 		 1342 aa  99  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1340 aa  99.4  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  25 
 
 		 1255 aa  99  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1259 aa  97.1  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1362 aa  97.1  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1290 aa  97.4  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1258 aa  97.1  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1259 aa  97.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1259 aa  97.1  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  24.54 
 
 		 1259 aa  96.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5739  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1259 aa  96.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  24.54 
 
 		 857 aa  96.3  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1259 aa  95.9  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  25.99 
 
 		 1246 aa  95.5  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1398 aa  94  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.048277 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>