174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0672 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  49.3 
 
 		 1304 aa  1201    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  49.11 
 
 		 1299 aa  1196    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  39.21 
 
 		 1372 aa  901    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  100 
 
 		 1401 aa  2773    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  49.26 
 
 		 1304 aa  1197    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  39.42 
 
 		 1372 aa  902    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5769  hypothetical protein  39.46 
 
 		 1360 aa  867    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0973726  normal  0.232191 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  39.45 
 
 		 1375 aa  913    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  46.92 
 
 		 1435 aa  714    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  71.66 
 
 		 1392 aa  1881    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  46.86 
 
 		 1443 aa  711    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1827  hypothetical protein  39.91 
 
 		 1347 aa  869    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  38.99 
 
 		 1358 aa  860    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2438  hypothetical protein  39.84 
 
 		 1347 aa  868    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2443  hypothetical protein  40.2 
 
 		 1347 aa  873    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  39.07 
 
 		 1360 aa  867    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  39.49 
 
 		 1372 aa  902    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  39.49 
 
 		 1372 aa  902    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  39.07 
 
 		 1372 aa  893    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  39.28 
 
 		 1372 aa  903    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  39.49 
 
 		 1372 aa  902    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  39.39 
 
 		 1448 aa  937    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  40.24 
 
 		 1346 aa  882    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  28.88 
 
 		 1243 aa  413  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  29.84 
 
 		 1056 aa  343  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1796  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1332 aa  334  7.000000000000001e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  32.28 
 
 		 1218 aa  238  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  25.92 
 
 		 1443 aa  234  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  29.61 
 
 		 1453 aa  223  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  29.57 
 
 		 1434 aa  218  5.9999999999999996e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  29.05 
 
 		 1378 aa  215  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  28.69 
 
 		 1380 aa  213  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  30.46 
 
 		 1292 aa  212  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  28.59 
 
 		 1346 aa  209  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  30.03 
 
 		 1361 aa  209  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  26.84 
 
 		 1473 aa  198  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1232 aa  173  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  24.53 
 
 		 1285 aa  160  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  25.08 
 
 		 1221 aa  155  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1221 aa  153  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  24.61 
 
 		 1224 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1352 aa  149  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  25.17 
 
 		 1206 aa  149  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  24.64 
 
 		 1285 aa  145  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  24.08 
 
 		 1223 aa  145  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1224 aa  144  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  24.04 
 
 		 1382 aa  140  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  22.65 
 
 		 1226 aa  136  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1273 aa  134  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1308 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  24.41 
 
 		 1273 aa  132  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  27.21 
 
 		 1485 aa  131  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  22.65 
 
 		 1229 aa  129  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  23.78 
 
 		 1025 aa  129  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1255 aa  129  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1259 aa  126  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1325 aa  127  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  22.82 
 
 		 1258 aa  125  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1259 aa  125  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1259 aa  125  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1259 aa  125  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  26.07 
 
 		 1485 aa  125  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1259 aa  124  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  26.81 
 
 		 1305 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  22.56 
 
 		 1224 aa  122  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1262 aa  122  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1344 aa  122  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1340 aa  121  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  22.54 
 
 		 1265 aa  119  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1344 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  23.7 
 
 		 1344 aa  120  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  23.57 
 
 		 1246 aa  119  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1341 aa  119  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1299 aa  119  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  25.59 
 
 		 1184 aa  114  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1226 aa  114  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  25.59 
 
 		 1184 aa  114  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  25.05 
 
 		 1385 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1377 aa  113  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  22.73 
 
 		 1342 aa  112  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1290 aa  112  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1319 aa  112  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1310 aa  111  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  25.62 
 
 		 1254 aa  111  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1304 aa  111  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1174 aa  110  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  28.64 
 
 		 1451 aa  108  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  26.44 
 
 		 1398 aa  107  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1449 aa  107  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  21.98 
 
 		 1254 aa  107  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3963  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1305 aa  106  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1283 aa  106  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3624  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1312 aa  106  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1319 aa  105  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3769  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1291 aa  105  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0291  hypothetical protein  24.31 
 
 		 929 aa  105  7e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1402 aa  105  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  26.2 
 
 		 1249 aa  104  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1899  hypothetical outer membrane protein  24.31 
 
 		 929 aa  104  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0551732  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  27.9 
 
 		 1441 aa  103  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.913216 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>