171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1657 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  41.3 
 
 		 1359 aa  977    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  37.3 
 
 		 1292 aa  761    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  44.9 
 
 		 1473 aa  1056    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  46.25 
 
 		 1380 aa  1033    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  43.92 
 
 		 1453 aa  990    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  100 
 
 		 1443 aa  2825    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  46.34 
 
 		 1378 aa  1046    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  34.2 
 
 		 1346 aa  607  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  33.65 
 
 		 1361 aa  575  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  29.7 
 
 		 1243 aa  249  4e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  29.32 
 
 		 1453 aa  231  7e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  35.02 
 
 		 1434 aa  229  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  30.62 
 
 		 1056 aa  225  4e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1401 aa  216  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1372 aa  212  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1372 aa  212  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1372 aa  212  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  27.9 
 
 		 1372 aa  212  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1372 aa  212  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1372 aa  211  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1372 aa  211  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  30.91 
 
 		 1375 aa  205  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  28.01 
 
 		 1346 aa  205  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  26.18 
 
 		 1299 aa  198  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1358 aa  197  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  30.68 
 
 		 1218 aa  196  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  30.63 
 
 		 1360 aa  193  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1435 aa  191  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  29.94 
 
 		 1304 aa  191  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  27.72 
 
 		 1443 aa  191  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1448 aa  190  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2443  hypothetical protein  29.93 
 
 		 1347 aa  187  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2438  hypothetical protein  29.93 
 
 		 1347 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  29.94 
 
 		 1304 aa  187  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1827  hypothetical protein  29.93 
 
 		 1347 aa  186  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1796  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1332 aa  182  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5769  hypothetical protein  29.56 
 
 		 1360 aa  182  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0973726  normal  0.232191 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1031  protein of unknown function DUF490  29.44 
 
 		 1426 aa  181  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  29.14 
 
 		 1392 aa  174  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  27.95 
 
 		 1308 aa  164  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  32.22 
 
 		 1352 aa  160  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  29.72 
 
 		 1232 aa  144  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1262 aa  138  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1223 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  27.22 
 
 		 1184 aa  135  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  27.22 
 
 		 1184 aa  135  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1325 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1224 aa  135  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1206 aa  135  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1224 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  34.62 
 
 		 1319 aa  134  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  35.56 
 
 		 1382 aa  134  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1377 aa  132  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1283 aa  130  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1226 aa  125  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  29.61 
 
 		 1485 aa  123  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  27.18 
 
 		 1221 aa  123  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1226 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1221 aa  122  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1224 aa  121  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  24 
 
 		 1229 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  30.31 
 
 		 1485 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  26.58 
 
 		 1290 aa  117  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  26.73 
 
 		 1254 aa  114  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  29.23 
 
 		 1342 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  26.08 
 
 		 1265 aa  112  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  29.23 
 
 		 1340 aa  111  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  27.77 
 
 		 1249 aa  111  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  25 
 
 		 1299 aa  111  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  27.78 
 
 		 1246 aa  108  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1259 aa  107  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3963  hypothetical protein  26.36 
 
 		 1305 aa  107  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1259 aa  107  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1259 aa  107  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1259 aa  107  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1259 aa  107  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3769  hypothetical protein  26.74 
 
 		 1291 aa  106  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1255 aa  106  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1174 aa  106  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3624  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1312 aa  106  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  25.04 
 
 		 1259 aa  105  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  23.26 
 
 		 1304 aa  103  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  29.74 
 
 		 1025 aa  102  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  31.51 
 
 		 1344 aa  102  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  31.51 
 
 		 1341 aa  102  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  31.51 
 
 		 1344 aa  102  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  31.51 
 
 		 1344 aa  102  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4700  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1259 aa  101  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0291  hypothetical protein  24.86 
 
 		 929 aa  100  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  31.76 
 
 		 1254 aa  100  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  25.89 
 
 		 1259 aa  99.4  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1259 aa  99.4  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1259 aa  99.4  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5739  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1259 aa  99.4  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1305 aa  99.4  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4860  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1259 aa  99  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1899  hypothetical outer membrane protein  24.86 
 
 		 929 aa  99.4  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0551732  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1259 aa  99.4  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1259 aa  99  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  25.68 
 
 		 857 aa  98.6  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>