154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1928 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  67.56 
 
 		 1385 aa  1826    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  98.44 
 
 		 1344 aa  2685    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1504  hypothetical protein  44.19 
 
 		 1355 aa  1092    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  66.67 
 
 		 1402 aa  1823    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  66.5 
 
 		 1398 aa  1810    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  47.72 
 
 		 1304 aa  1271    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  64.54 
 
 		 1449 aa  1809    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  46.45 
 
 		 1297 aa  1144    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  97.17 
 
 		 1341 aa  2598    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  44.74 
 
 		 1299 aa  1120    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  70.28 
 
 		 1305 aa  1914    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  100 
 
 		 1344 aa  2724    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  45.49 
 
 		 1290 aa  1180    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  46.15 
 
 		 1319 aa  1238    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  43.54 
 
 		 1353 aa  1092    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  99.55 
 
 		 1344 aa  2711    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  26.57 
 
 		 1259 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  27 
 
 		 1259 aa  452  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  26.57 
 
 		 1259 aa  452  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  26.57 
 
 		 1259 aa  452  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  27 
 
 		 1259 aa  452  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  26.86 
 
 		 1259 aa  446  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1259 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1258 aa  440  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  26.78 
 
 		 1259 aa  443  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  26.87 
 
 		 1259 aa  442  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1259 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4700  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1259 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  27.95 
 
 		 1340 aa  437  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0460  hypothetical protein  27.99 
 
 		 1256 aa  439  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.524454  normal  0.757907 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5739  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1259 aa  434  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4860  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1259 aa  435  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3963  hypothetical protein  27.28 
 
 		 1305 aa  434  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  27.43 
 
 		 1342 aa  431  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3769  hypothetical protein  27.24 
 
 		 1291 aa  433  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3624  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1312 aa  428  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1254 aa  409  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  26.04 
 
 		 1249 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1310 aa  378  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  26.43 
 
 		 1246 aa  379  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1290 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1283 aa  373  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  25.4 
 
 		 1254 aa  371  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1265 aa  360  7e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  28.77 
 
 		 857 aa  334  6e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1259 aa  331  6e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1319 aa  324  9.000000000000001e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1914  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1328 aa  313  1e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.131903  normal  0.0193441 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1223 aa  307  7e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  27.79 
 
 		 1224 aa  301  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  27.57 
 
 		 1224 aa  296  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1206 aa  295  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1224 aa  280  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  28.22 
 
 		 1229 aa  279  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1352 aa  276  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1174 aa  274  8.000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  27.99 
 
 		 1226 aa  272  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  27.76 
 
 		 1221 aa  264  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  25.02 
 
 		 1226 aa  263  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1221 aa  263  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0340  hypothetical protein  26.16 
 
 		 1174 aa  236  3e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1255 aa  234  9e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  24.64 
 
 		 1382 aa  226  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1232 aa  226  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1509  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1664 aa  207  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1262 aa  205  5e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1688  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1664 aa  205  6e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1606  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1773 aa  199  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0503817  hitchhiker  0.0000303134 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04025  hypothetical protein  29.18 
 
 		 1302 aa  172  5e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  22.04 
 
 		 1025 aa  154  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0607  hypothetical protein  23.35 
 
 		 982 aa  147  1e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  23.96 
 
 		 1243 aa  130  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  22.09 
 
 		 1285 aa  121  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  22.37 
 
 		 1273 aa  120  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  22.49 
 
 		 1273 aa  119  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  24.39 
 
 		 1443 aa  118  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1218 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1448 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  24.95 
 
 		 1308 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1325 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  24.12 
 
 		 1435 aa  110  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  23.38 
 
 		 1401 aa  110  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  21.33 
 
 		 1285 aa  108  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  25.8 
 
 		 1377 aa  108  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  26.35 
 
 		 1184 aa  106  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1184 aa  106  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0291  hypothetical protein  24.14 
 
 		 929 aa  105  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1899  hypothetical outer membrane protein  23.91 
 
 		 929 aa  104  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0551732  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  23.1 
 
 		 1304 aa  103  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1360 aa  101  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  24.17 
 
 		 1358 aa  101  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1346 aa  99  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  26.05 
 
 		 1304 aa  97.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  26.04 
 
 		 1485 aa  96.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  26.68 
 
 		 1299 aa  95.5  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1770  hypothetical protein  24.77 
 
 		 846 aa  95.5  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2438  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1347 aa  94.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  25.82 
 
 		 1485 aa  93.6  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5769  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1360 aa  94  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0973726  normal  0.232191 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1827  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1347 aa  94  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>