154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4679 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  86.34 
 
 
1259 aa  2259    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  86.58 
 
 
1259 aa  2263    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  56.71 
 
 
1340 aa  1485    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4700  hypothetical protein  86.42 
 
 
1259 aa  2260    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  99.68 
 
 
1259 aa  2530    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4860  hypothetical protein  86.1 
 
 
1259 aa  2250    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  88.91 
 
 
857 aa  1580    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  56.07 
 
 
1342 aa  1479    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5739  hypothetical protein  86.42 
 
 
1259 aa  2260    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  53.18 
 
 
1246 aa  1318    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  34.1 
 
 
1254 aa  728    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  52.64 
 
 
1249 aa  1326    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  99.68 
 
 
1259 aa  2529    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  84.11 
 
 
1258 aa  2196    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  33.55 
 
 
1254 aa  743    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  86.34 
 
 
1259 aa  2258    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3769  hypothetical protein  58.35 
 
 
1291 aa  1541    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3624  hypothetical protein  57.42 
 
 
1312 aa  1503    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  99.52 
 
 
1259 aa  2524    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  100 
 
 
1259 aa  2534    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  34.23 
 
 
1290 aa  751    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  86.34 
 
 
1259 aa  2258    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  86.42 
 
 
1259 aa  2261    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0460  hypothetical protein  63.43 
 
 
1256 aa  1656    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.524454  normal  0.757907 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  32.32 
 
 
1265 aa  719    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3963  hypothetical protein  58.2 
 
 
1305 aa  1528    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  99.52 
 
 
1259 aa  2526    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  30.51 
 
 
1319 aa  556  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0340  hypothetical protein  37.84 
 
 
1174 aa  517  1.0000000000000001e-145  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0607  hypothetical protein  36.43 
 
 
982 aa  502  1e-140  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  30.03 
 
 
1283 aa  494  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  28.91 
 
 
1259 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  26.98 
 
 
1344 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  26.57 
 
 
1344 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  26.57 
 
 
1341 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  26.49 
 
 
1344 aa  439  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  27.64 
 
 
1305 aa  433  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  25.86 
 
 
1290 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1914  hypothetical protein  24.34 
 
 
1328 aa  426  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.131903  normal  0.0193441 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  25.93 
 
 
1304 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  25.35 
 
 
1299 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  24.6 
 
 
1319 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  27.63 
 
 
1224 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  27.72 
 
 
1206 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  25.82 
 
 
1385 aa  383  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  27.91 
 
 
1224 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  24.92 
 
 
1353 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  27.24 
 
 
1226 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  28.07 
 
 
1223 aa  373  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  26.25 
 
 
1297 aa  373  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  30.67 
 
 
1224 aa  365  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  24.57 
 
 
1398 aa  365  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  29.85 
 
 
1229 aa  365  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  27.04 
 
 
1221 aa  364  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  27.02 
 
 
1221 aa  364  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  26.19 
 
 
1226 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  27.29 
 
 
1174 aa  340  7e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  29.53 
 
 
1232 aa  340  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  28.94 
 
 
1255 aa  332  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  26.31 
 
 
1262 aa  330  7e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1504  hypothetical protein  25.95 
 
 
1355 aa  326  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04025  hypothetical protein  26.51 
 
 
1302 aa  320  1e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  27.72 
 
 
1449 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  22.99 
 
 
1310 aa  300  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  27.8 
 
 
1402 aa  298  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  28.32 
 
 
1352 aa  285  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  27.51 
 
 
1382 aa  283  1e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1688  hypothetical protein  23.52 
 
 
1664 aa  261  5.0000000000000005e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1509  hypothetical protein  23.21 
 
 
1664 aa  257  8e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1606  hypothetical protein  23.27 
 
 
1773 aa  246  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0503817  hitchhiker  0.0000303134 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  26.35 
 
 
1285 aa  206  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  25.86 
 
 
1285 aa  205  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  25.4 
 
 
1273 aa  192  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  25.45 
 
 
1273 aa  192  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  27.09 
 
 
1308 aa  177  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  24.81 
 
 
1025 aa  175  3.9999999999999995e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  26.53 
 
 
1377 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  25.68 
 
 
1325 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  24.46 
 
 
1243 aa  141  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  24.35 
 
 
1485 aa  132  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  23.54 
 
 
1485 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  27.89 
 
 
1453 aa  124  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  25.25 
 
 
1435 aa  122  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  23.01 
 
 
1401 aa  120  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  27.84 
 
 
1184 aa  118  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  27.84 
 
 
1184 aa  118  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  24.75 
 
 
1448 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  24.84 
 
 
1443 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  27.04 
 
 
1378 aa  116  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1771  hypothetical protein  28.42 
 
 
846 aa  115  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1770  hypothetical protein  28.16 
 
 
846 aa  115  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  24.47 
 
 
1359 aa  114  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  23.65 
 
 
1056 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1796  hypothetical protein  35.36 
 
 
1332 aa  113  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  26.43 
 
 
1380 aa  109  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  27.06 
 
 
1361 aa  105  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0291  hypothetical protein  25.88 
 
 
929 aa  106  4e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1899  hypothetical outer membrane protein  25.65 
 
 
929 aa  103  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0551732  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  28.37 
 
 
1218 aa  100  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  24.32 
 
 
1375 aa  100  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>