153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2438 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  43.21 
 
 		 1299 aa  963    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  73.14 
 
 		 1372 aa  1938    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  39.34 
 
 		 1401 aa  860    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2443  hypothetical protein  99.41 
 
 		 1347 aa  2630    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  73.29 
 
 		 1372 aa  1942    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5769  hypothetical protein  93.84 
 
 		 1360 aa  2386    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0973726  normal  0.232191 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  62.42 
 
 		 1448 aa  1311    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  72.81 
 
 		 1375 aa  1941    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  88.9 
 
 		 1360 aa  2313    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  59.17 
 
 		 1435 aa  1581    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  39.69 
 
 		 1392 aa  863    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1827  hypothetical protein  99.93 
 
 		 1347 aa  2641    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  89.32 
 
 		 1358 aa  2319    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2438  hypothetical protein  100 
 
 		 1347 aa  2643    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  73.22 
 
 		 1372 aa  1940    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  73.22 
 
 		 1372 aa  1940    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  73.07 
 
 		 1372 aa  1933    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  73.14 
 
 		 1372 aa  1941    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  73.22 
 
 		 1372 aa  1940    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  60.23 
 
 		 1443 aa  1616    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  43.56 
 
 		 1304 aa  975    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  88.98 
 
 		 1346 aa  2233    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  43.04 
 
 		 1304 aa  969    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  30.77 
 
 		 1243 aa  379  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1796  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1332 aa  313  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1031  protein of unknown function DUF490  31.18 
 
 		 1426 aa  283  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  29.5 
 
 		 1056 aa  279  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  32.52 
 
 		 1218 aa  213  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1453 aa  213  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  27.08 
 
 		 1359 aa  201  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1453 aa  189  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  29.15 
 
 		 1434 aa  189  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1443 aa  184  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  26.66 
 
 		 1378 aa  177  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1346 aa  176  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1361 aa  174  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  26.78 
 
 		 1380 aa  174  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1473 aa  166  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  27.8 
 
 		 1292 aa  161  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1352 aa  131  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  22.62 
 
 		 1262 aa  127  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1308 aa  126  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  25.3 
 
 		 1224 aa  119  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1319 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1223 aa  115  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  24.95 
 
 		 1224 aa  115  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1206 aa  112  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  26.92 
 
 		 1382 aa  108  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1226 aa  106  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  25.75 
 
 		 1485 aa  106  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1325 aa  106  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1221 aa  104  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  26.3 
 
 		 1025 aa  102  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1221 aa  102  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1297 aa  101  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1229 aa  100  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1310 aa  99.8  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1377 aa  99.4  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  25.05 
 
 		 1344 aa  98.2  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1341 aa  98.2  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  24.77 
 
 		 1485 aa  98.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1259 aa  95.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  24.1 
 
 		 1259 aa  95.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  24.41 
 
 		 1344 aa  95.1  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1259 aa  94.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  24.1 
 
 		 1259 aa  94.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  24.1 
 
 		 1259 aa  94.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  23.44 
 
 		 1285 aa  93.6  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  24.21 
 
 		 1344 aa  91.7  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  23.79 
 
 		 1290 aa  91.7  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  28.49 
 
 		 1232 aa  90.9  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1224 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  24.02 
 
 		 1285 aa  89.4  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1319 aa  88.6  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1283 aa  87.4  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1462 aa  87  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  22 
 
 		 1258 aa  87  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1305 aa  87.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  29.25 
 
 		 1254 aa  85.1  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1226 aa  85.1  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  24.96 
 
 		 1273 aa  81.6  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1299 aa  81.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  22.5 
 
 		 1265 aa  80.5  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1688  hypothetical protein  25.22 
 
 		 1664 aa  80.1  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  25 
 
 		 1290 aa  79.3  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1509  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1664 aa  78.2  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  26.58 
 
 		 1174 aa  77.8  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  24.5 
 
 		 1273 aa  78.2  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5739  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1259 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  23.1 
 
 		 1259 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1259 aa  77.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1259 aa  76.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  22.77 
 
 		 1259 aa  76.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  24.41 
 
 		 1184 aa  76.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  23.93 
 
 		 1550 aa  76.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  24.41 
 
 		 1184 aa  76.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1259 aa  76.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1899  hypothetical outer membrane protein  24.66 
 
 		 929 aa  75.9  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0551732  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0291  hypothetical protein  24.46 
 
 		 929 aa  75.9  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1385 aa  75.9  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>