172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3162 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  100 
 
 		 1453 aa  2774    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  50.62 
 
 		 1434 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  28.8 
 
 		 1346 aa  288  7e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  36.14 
 
 		 1292 aa  274  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  35.94 
 
 		 1361 aa  264  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  27.07 
 
 		 1304 aa  247  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  33.99 
 
 		 1359 aa  244  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  33.69 
 
 		 1056 aa  243  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  34.46 
 
 		 1243 aa  243  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  26.78 
 
 		 1304 aa  242  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  29.31 
 
 		 1443 aa  240  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  31.27 
 
 		 1378 aa  236  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  32.09 
 
 		 1380 aa  231  5e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  36.21 
 
 		 1473 aa  229  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  29.5 
 
 		 1401 aa  226  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  29.62 
 
 		 1392 aa  224  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  26.54 
 
 		 1299 aa  224  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1358 aa  221  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  35.46 
 
 		 1453 aa  218  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  31.54 
 
 		 1218 aa  208  6e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  29.64 
 
 		 1346 aa  208  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1796  hypothetical protein  31.55 
 
 		 1332 aa  207  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1360 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  32.8 
 
 		 1372 aa  201  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  32.8 
 
 		 1372 aa  200  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  32.57 
 
 		 1372 aa  198  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  32.57 
 
 		 1372 aa  198  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  32.57 
 
 		 1372 aa  198  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  32.57 
 
 		 1372 aa  198  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  32.57 
 
 		 1372 aa  198  7e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1031  protein of unknown function DUF490  33.03 
 
 		 1426 aa  197  9e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1827  hypothetical protein  29.13 
 
 		 1347 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2438  hypothetical protein  29.13 
 
 		 1347 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  28.5 
 
 		 1435 aa  196  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2443  hypothetical protein  29.13 
 
 		 1347 aa  195  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  32.12 
 
 		 1375 aa  194  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5769  hypothetical protein  28.62 
 
 		 1360 aa  193  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0973726  normal  0.232191 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1448 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  28.48 
 
 		 1443 aa  186  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  33.42 
 
 		 1352 aa  157  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  27.55 
 
 		 1262 aa  147  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  30.9 
 
 		 1308 aa  142  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1325 aa  140  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  27.76 
 
 		 1226 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  31.33 
 
 		 1382 aa  134  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  26.84 
 
 		 1229 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  29.55 
 
 		 1206 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  29.31 
 
 		 1224 aa  129  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  30.84 
 
 		 1319 aa  129  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  29.22 
 
 		 1223 aa  129  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  30.28 
 
 		 1224 aa  129  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1259 aa  129  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1259 aa  129  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  27.07 
 
 		 1259 aa  128  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1258 aa  129  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  27.07 
 
 		 1259 aa  128  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  30.89 
 
 		 1377 aa  128  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  27.07 
 
 		 1259 aa  128  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  31.18 
 
 		 1246 aa  127  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3963  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1305 aa  127  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  30.79 
 
 		 1232 aa  127  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  30.97 
 
 		 1283 aa  126  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3624  hypothetical protein  29.05 
 
 		 1312 aa  125  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3769  hypothetical protein  29.05 
 
 		 1291 aa  125  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1221 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1224 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  30.12 
 
 		 1342 aa  122  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  28.31 
 
 		 1273 aa  123  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  28.31 
 
 		 1273 aa  123  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1184 aa  122  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  26.29 
 
 		 1184 aa  122  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1221 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4700  hypothetical protein  27.77 
 
 		 1259 aa  122  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  30.21 
 
 		 1174 aa  121  9e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1259 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  27.97 
 
 		 1259 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  27.97 
 
 		 857 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  28.97 
 
 		 1340 aa  120  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1259 aa  121  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1259 aa  121  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1259 aa  120  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5739  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1259 aa  120  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4860  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1259 aa  119  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1310 aa  119  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  31.59 
 
 		 1285 aa  119  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  27.82 
 
 		 1265 aa  119  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  30.64 
 
 		 1249 aa  118  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  28.94 
 
 		 1285 aa  118  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  23.97 
 
 		 1290 aa  116  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1297 aa  116  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  25.39 
 
 		 1319 aa  116  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  27.48 
 
 		 1254 aa  116  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0460  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1256 aa  115  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.524454  normal  0.757907 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1304 aa  114  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  26.79 
 
 		 1353 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1226 aa  111  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1255 aa  110  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1259 aa  108  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1299 aa  108  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1290 aa  105  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>