157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0295 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  36.86 
 
 		 1352 aa  679    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  100 
 
 		 1382 aa  2640    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  30.48 
 
 		 1262 aa  355  4e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  30.7 
 
 		 1224 aa  321  7e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0460  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1256 aa  311  5e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.524454  normal  0.757907 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  29.29 
 
 		 1249 aa  308  7e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  32.19 
 
 		 1224 aa  303  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  32.71 
 
 		 1223 aa  303  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  32.11 
 
 		 1206 aa  301  7e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  31.88 
 
 		 1224 aa  300  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  31.99 
 
 		 1283 aa  296  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  27.92 
 
 		 1340 aa  295  3e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  30.55 
 
 		 1226 aa  295  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1259 aa  294  8e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1259 aa  294  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1259 aa  293  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1259 aa  293  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  27.56 
 
 		 1246 aa  293  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  30.13 
 
 		 1229 aa  292  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  31.9 
 
 		 1232 aa  292  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  27.4 
 
 		 1259 aa  291  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  28.32 
 
 		 1342 aa  290  9e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1258 aa  288  4e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3624  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1312 aa  288  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3769  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1291 aa  288  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3963  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1305 aa  286  1.0000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4700  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1259 aa  285  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  31.62 
 
 		 1221 aa  285  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  27.4 
 
 		 1259 aa  285  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  27.4 
 
 		 1259 aa  285  6.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  27.4 
 
 		 857 aa  284  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  27.4 
 
 		 1259 aa  284  9e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  27.28 
 
 		 1259 aa  282  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  27.28 
 
 		 1259 aa  282  4e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5739  hypothetical protein  27.4 
 
 		 1259 aa  282  4e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  31.55 
 
 		 1221 aa  277  9e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  32.03 
 
 		 1226 aa  277  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4860  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1259 aa  274  7e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1259 aa  259  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1255 aa  253  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  26.87 
 
 		 1273 aa  250  2e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1254 aa  249  4e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  26.87 
 
 		 1273 aa  248  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  29.56 
 
 		 1174 aa  247  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  26.26 
 
 		 1285 aa  246  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  24.65 
 
 		 1254 aa  243  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  26.71 
 
 		 1285 aa  243  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  24.05 
 
 		 1265 aa  235  5e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1305 aa  234  9e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1344 aa  234  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  24.57 
 
 		 1344 aa  231  7e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  24.71 
 
 		 1344 aa  228  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1341 aa  226  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1290 aa  224  7e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1319 aa  224  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1353 aa  217  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1290 aa  213  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1688  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1664 aa  213  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  26.05 
 
 		 1025 aa  212  3e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  24.08 
 
 		 1385 aa  209  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1509  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1664 aa  207  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1299 aa  205  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1398 aa  205  5e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1297 aa  205  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  22.45 
 
 		 1449 aa  203  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1402 aa  202  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0340  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1174 aa  200  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  28.43 
 
 		 1243 aa  192  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  21.82 
 
 		 1304 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1504  hypothetical protein  22.95 
 
 		 1355 aa  191  8e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  30.38 
 
 		 1308 aa  189  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  29.44 
 
 		 1325 aa  188  8e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1914  hypothetical protein  20 
 
 		 1328 aa  184  8.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.131903  normal  0.0193441 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04025  hypothetical protein  25 
 
 		 1302 aa  183  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  22.68 
 
 		 1310 aa  181  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1606  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1773 aa  181  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0503817  hitchhiker  0.0000303134 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1377 aa  169  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  24.04 
 
 		 1184 aa  169  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1184 aa  169  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  28.4 
 
 		 1485 aa  164  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  25.25 
 
 		 1299 aa  161  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1770  hypothetical protein  25.3 
 
 		 846 aa  158  8e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0607  hypothetical protein  21.22 
 
 		 982 aa  156  2.9999999999999998e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  26.56 
 
 		 1485 aa  154  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1434 aa  151  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1771  hypothetical protein  24.1 
 
 		 846 aa  150  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1031  protein of unknown function DUF490  27.51 
 
 		 1426 aa  147  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1401 aa  145  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1899  hypothetical outer membrane protein  26.85 
 
 		 929 aa  142  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0551732  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0291  hypothetical protein  26.62 
 
 		 929 aa  142  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  24.03 
 
 		 1392 aa  138  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1372 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1372 aa  137  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1372 aa  137  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1056 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1372 aa  137  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1372 aa  137  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1372 aa  137  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1372 aa  136  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  25.23 
 
 		 1304 aa  134  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.247605 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>