149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3415 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  57.58 
 
 		 1259 aa  1531    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  57.5 
 
 		 1259 aa  1529    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5739  hypothetical protein  57.73 
 
 		 1259 aa  1528    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  57.35 
 
 		 1259 aa  1534    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  100 
 
 		 1340 aa  2675    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  57.27 
 
 		 1259 aa  1530    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  35.31 
 
 		 1254 aa  665    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  32.39 
 
 		 1265 aa  724    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  57.35 
 
 		 1259 aa  1533    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  65.69 
 
 		 857 aa  1168    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  64.48 
 
 		 1246 aa  1397    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  56.5 
 
 		 1249 aa  1487    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  94.64 
 
 		 1342 aa  2477    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  57.74 
 
 		 1258 aa  1540    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  32.46 
 
 		 1254 aa  690    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  57.27 
 
 		 1259 aa  1531    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4860  hypothetical protein  57.35 
 
 		 1259 aa  1521    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3624  hypothetical protein  65.15 
 
 		 1312 aa  1746    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  57.35 
 
 		 1259 aa  1533    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  33.66 
 
 		 1290 aa  731    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  57.81 
 
 		 1259 aa  1532    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  57.65 
 
 		 1259 aa  1532    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0460  hypothetical protein  68.62 
 
 		 1256 aa  1806    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.524454  normal  0.757907 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3963  hypothetical protein  65.09 
 
 		 1305 aa  1742    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3769  hypothetical protein  64.91 
 
 		 1291 aa  1742    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  57.5 
 
 		 1259 aa  1529    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4700  hypothetical protein  57.58 
 
 		 1259 aa  1532    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  32.53 
 
 		 1319 aa  587  1e-166  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0607  hypothetical protein  37.91 
 
 		 982 aa  526  1e-148  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0340  hypothetical protein  35.73 
 
 		 1174 aa  494  9.999999999999999e-139  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  28.51 
 
 		 1344 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1341 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  28.22 
 
 		 1344 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1304 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  28.3 
 
 		 1344 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  30.82 
 
 		 1283 aa  444  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  27.82 
 
 		 1305 aa  430  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  30.37 
 
 		 1259 aa  421  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  26.72 
 
 		 1385 aa  415  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1914  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1328 aa  405  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.131903  normal  0.0193441 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1398 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1297 aa  392  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  30.49 
 
 		 1224 aa  365  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  30.38 
 
 		 1224 aa  365  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  31 
 
 		 1232 aa  362  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  30.27 
 
 		 1206 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  30.45 
 
 		 1223 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1353 aa  362  3e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  26.72 
 
 		 1290 aa  359  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  30.52 
 
 		 1221 aa  358  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  29.62 
 
 		 1221 aa  358  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  29.8 
 
 		 1224 aa  358  5e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  27.99 
 
 		 1226 aa  355  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1229 aa  352  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  26.08 
 
 		 1319 aa  347  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1299 aa  341  5e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  29.31 
 
 		 1226 aa  336  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1174 aa  336  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1262 aa  327  9e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1504  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1355 aa  316  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  28.64 
 
 		 1255 aa  316  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  27.77 
 
 		 1449 aa  300  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04025  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1302 aa  299  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  27.71 
 
 		 1382 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  29.32 
 
 		 1352 aa  286  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  22.27 
 
 		 1310 aa  281  6e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1688  hypothetical protein  24.26 
 
 		 1664 aa  270  2e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1606  hypothetical protein  25 
 
 		 1773 aa  268  5e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0503817  hitchhiker  0.0000303134 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1509  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1664 aa  264  8.999999999999999e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  25.76 
 
 		 1285 aa  201  6e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  25.14 
 
 		 1285 aa  189  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1273 aa  179  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  24.21 
 
 		 1273 aa  179  4e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  23.95 
 
 		 1025 aa  168  5.9999999999999996e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  26.45 
 
 		 1308 aa  142  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1402 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  23.91 
 
 		 1485 aa  126  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1325 aa  126  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  23.83 
 
 		 1243 aa  125  6e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1377 aa  124  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  25.16 
 
 		 1359 aa  119  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  30.82 
 
 		 1453 aa  118  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1401 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  24.02 
 
 		 1485 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1770  hypothetical protein  26.87 
 
 		 846 aa  113  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1771  hypothetical protein  26.65 
 
 		 846 aa  111  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0291  hypothetical protein  24.46 
 
 		 929 aa  110  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  25.11 
 
 		 1378 aa  109  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1899  hypothetical outer membrane protein  24.25 
 
 		 929 aa  108  5e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0551732  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  29.6 
 
 		 1184 aa  107  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  29.6 
 
 		 1184 aa  107  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  25.47 
 
 		 1361 aa  105  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1443 aa  106  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  24.17 
 
 		 1392 aa  105  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  24.97 
 
 		 1435 aa  105  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1372 aa  103  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1372 aa  103  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  23.52 
 
 		 1056 aa  103  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1380 aa  103  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  24.08 
 
 		 1372 aa  103  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>