141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1606 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1509  hypothetical protein  56.43 
 
 
1664 aa  1323    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1688  hypothetical protein  61.43 
 
 
1664 aa  1327    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1606  hypothetical protein  100 
 
 
1773 aa  3597    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0503817  hitchhiker  0.0000303134 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  27.43 
 
 
1283 aa  333  1e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  28.01 
 
 
1226 aa  300  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  25.99 
 
 
1232 aa  296  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  26.68 
 
 
1229 aa  293  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  25.59 
 
 
1265 aa  292  4e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  26.72 
 
 
1221 aa  291  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  25.8 
 
 
1246 aa  288  5.999999999999999e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  27.28 
 
 
1224 aa  287  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  26.62 
 
 
1221 aa  286  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  26.94 
 
 
1223 aa  284  9e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  25.86 
 
 
1249 aa  280  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  26.42 
 
 
1224 aa  278  7e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  25.54 
 
 
1319 aa  275  6e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  26.32 
 
 
1224 aa  275  7e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  24.42 
 
 
1258 aa  273  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  25.68 
 
 
1206 aa  273  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3963  hypothetical protein  25.97 
 
 
1305 aa  270  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  25 
 
 
1340 aa  270  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3624  hypothetical protein  25.97 
 
 
1312 aa  268  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3769  hypothetical protein  25.86 
 
 
1291 aa  268  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  24.71 
 
 
1342 aa  265  4.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  26.72 
 
 
1226 aa  264  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.751068 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  23.22 
 
 
1259 aa  263  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  26.22 
 
 
1254 aa  263  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  24.36 
 
 
1254 aa  263  3e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4700  hypothetical protein  23.22 
 
 
1259 aa  263  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  23.39 
 
 
1259 aa  262  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  23.13 
 
 
1259 aa  261  7e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5739  hypothetical protein  24 
 
 
1259 aa  261  9e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  23.04 
 
 
1259 aa  261  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  23.3 
 
 
1259 aa  260  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0460  hypothetical protein  24.76 
 
 
1256 aa  259  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.524454  normal  0.757907 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4860  hypothetical protein  23.35 
 
 
1259 aa  259  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  24.4 
 
 
857 aa  257  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  25.23 
 
 
1259 aa  254  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  24.66 
 
 
1299 aa  251  7e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  25.42 
 
 
1304 aa  250  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  25.57 
 
 
1255 aa  249  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  25.5 
 
 
1290 aa  248  6e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  23.27 
 
 
1259 aa  247  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  25.69 
 
 
1290 aa  246  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  23.27 
 
 
1259 aa  246  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  23.27 
 
 
1259 aa  246  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  23.27 
 
 
1259 aa  245  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  23.16 
 
 
1259 aa  244  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  24.43 
 
 
1174 aa  243  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1914  hypothetical protein  23.52 
 
 
1328 aa  226  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.131903  normal  0.0193441 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0340  hypothetical protein  24.52 
 
 
1174 aa  225  7e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  24.21 
 
 
1319 aa  219  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  28.18 
 
 
1305 aa  212  6e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1504  hypothetical protein  25.35 
 
 
1355 aa  206  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  27.3 
 
 
1385 aa  206  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  26.8 
 
 
1402 aa  204  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  26.97 
 
 
1398 aa  202  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  27.18 
 
 
1449 aa  201  9e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  26.22 
 
 
1344 aa  199  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  26.97 
 
 
1344 aa  199  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  26.22 
 
 
1344 aa  199  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  25.87 
 
 
1341 aa  195  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  21.97 
 
 
1297 aa  194  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  22 
 
 
1352 aa  190  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  22.91 
 
 
1262 aa  177  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04025  hypothetical protein  24.62 
 
 
1302 aa  176  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  22.13 
 
 
1310 aa  174  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  22.47 
 
 
1382 aa  174  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  25.16 
 
 
1273 aa  163  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  25.16 
 
 
1273 aa  162  4e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  25.5 
 
 
1353 aa  161  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  25.76 
 
 
1285 aa  146  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  24.05 
 
 
1285 aa  142  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0607  hypothetical protein  21.4 
 
 
982 aa  140  2e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  25.43 
 
 
1025 aa  129  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  23.6 
 
 
1308 aa  110  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  21.24 
 
 
1401 aa  106  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1770  hypothetical protein  23.33 
 
 
846 aa  99.8  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  24.4 
 
 
1325 aa  99.4  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1771  hypothetical protein  24.72 
 
 
846 aa  97.1  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  26.8 
 
 
1434 aa  95.1  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0291  hypothetical protein  24.2 
 
 
929 aa  94.4  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1899  hypothetical outer membrane protein  23.99 
 
 
929 aa  93.2  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0551732  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  26.65 
 
 
1448 aa  92.4  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  23.7 
 
 
1056 aa  90.9  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  26.73 
 
 
1392 aa  90.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  22.17 
 
 
1377 aa  89  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  26.42 
 
 
1292 aa  89  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  28.18 
 
 
1435 aa  86.3  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  27.55 
 
 
1443 aa  84.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  27.76 
 
 
1358 aa  84.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  27.76 
 
 
1360 aa  84.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  24.73 
 
 
1304 aa  83.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  25.72 
 
 
1218 aa  82.4  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  24.73 
 
 
1304 aa  82.8  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  25.59 
 
 
1299 aa  81.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  23.02 
 
 
1485 aa  80.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  23.51 
 
 
1443 aa  81.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1796  hypothetical protein  23.03 
 
 
1332 aa  79.7  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  24.46 
 
 
1346 aa  79.7  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>