165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A2307 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2383  putative signal peptide protein  42.88 
 
 
1299 aa  951    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00682258 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  99.85 
 
 
1372 aa  2672    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  42.45 
 
 
1304 aa  961    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.346321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  39.6 
 
 
1401 aa  884    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2443  hypothetical protein  73.8 
 
 
1347 aa  1918    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295453  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  99.78 
 
 
1372 aa  2670    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5769  hypothetical protein  73.43 
 
 
1360 aa  1929    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0973726  normal  0.232191 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  92.27 
 
 
1375 aa  2425    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  60 
 
 
1435 aa  1619    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  39.42 
 
 
1392 aa  897    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1827  hypothetical protein  73.43 
 
 
1347 aa  1911    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  72.34 
 
 
1360 aa  1925    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2192  protein of unknown function DUF490  42.96 
 
 
1304 aa  966    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.247605 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  72.84 
 
 
1358 aa  1925    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2438  hypothetical protein  73.51 
 
 
1347 aa  1914    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  59.59 
 
 
1443 aa  1625    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  100 
 
 
1372 aa  2675    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  100 
 
 
1372 aa  2675    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  99.49 
 
 
1372 aa  2663    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  99.93 
 
 
1372 aa  2674    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  100 
 
 
1372 aa  2675    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  63.45 
 
 
1448 aa  1313    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  74.4 
 
 
1346 aa  1914    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  30.81 
 
 
1243 aa  399  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1796  hypothetical protein  26.26 
 
 
1332 aa  338  2.9999999999999997e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  28.67 
 
 
1056 aa  293  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1031  protein of unknown function DUF490  30.4 
 
 
1426 aa  290  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  30.61 
 
 
1359 aa  224  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  32.02 
 
 
1218 aa  224  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  29.27 
 
 
1453 aa  216  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  31.81 
 
 
1292 aa  207  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  30.39 
 
 
1346 aa  207  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  27.17 
 
 
1443 aa  206  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  29.88 
 
 
1361 aa  199  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  28.61 
 
 
1380 aa  197  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  29.06 
 
 
1378 aa  197  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  28.32 
 
 
1434 aa  196  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  31.22 
 
 
1453 aa  192  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  25.72 
 
 
1352 aa  152  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  25.24 
 
 
1382 aa  135  6e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  26.12 
 
 
1308 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  26.22 
 
 
1319 aa  126  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  24.71 
 
 
1223 aa  121  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  25.45 
 
 
1485 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  24.84 
 
 
1262 aa  116  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  27.83 
 
 
1025 aa  114  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  24.01 
 
 
1206 aa  113  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  27.98 
 
 
1377 aa  112  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  23.79 
 
 
1224 aa  111  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  25.5 
 
 
1325 aa  109  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  23.93 
 
 
1224 aa  108  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  24.25 
 
 
1297 aa  106  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  25.11 
 
 
1485 aa  106  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  29.19 
 
 
1226 aa  103  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  24.52 
 
 
1221 aa  102  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  24.28 
 
 
1340 aa  101  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  29.5 
 
 
1232 aa  100  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  28.17 
 
 
1229 aa  100  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  25.68 
 
 
1462 aa  100  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  27.39 
 
 
1224 aa  99.8  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  22.75 
 
 
1254 aa  100  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  23.71 
 
 
1285 aa  99  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  23.97 
 
 
1342 aa  98.2  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  26.73 
 
 
1221 aa  97.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  23.9 
 
 
1259 aa  97.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  23.9 
 
 
1310 aa  96.3  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  23.9 
 
 
1259 aa  96.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  23.9 
 
 
1259 aa  96.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  24.35 
 
 
1305 aa  95.9  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  23.9 
 
 
1259 aa  95.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0460  hypothetical protein  23.26 
 
 
1256 aa  95.9  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.524454  normal  0.757907 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  23.59 
 
 
857 aa  95.5  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  23.65 
 
 
1259 aa  95.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  23.45 
 
 
1259 aa  95.5  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  23.45 
 
 
1259 aa  95.5  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4700  hypothetical protein  23.45 
 
 
1259 aa  95.1  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  23.35 
 
 
1273 aa  95.1  8e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0291  hypothetical protein  25.06 
 
 
929 aa  95.1  8e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  23.38 
 
 
1259 aa  95.1  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1899  hypothetical outer membrane protein  25.28 
 
 
929 aa  95.1  9e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0551732  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5739  hypothetical protein  23.45 
 
 
1259 aa  94.4  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  23.45 
 
 
1259 aa  94.4  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  23.46 
 
 
1273 aa  94  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  23.33 
 
 
1259 aa  94.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  27.13 
 
 
1174 aa  92.8  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4860  hypothetical protein  23.45 
 
 
1259 aa  92.4  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  25.12 
 
 
1285 aa  92.4  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  22.96 
 
 
1258 aa  89.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  28.57 
 
 
1226 aa  90.1  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  26.19 
 
 
1344 aa  89.7  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  26.19 
 
 
1344 aa  89.4  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  26.59 
 
 
1283 aa  89.4  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  31.54 
 
 
1290 aa  89.4  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  26.19 
 
 
1344 aa  89  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  26.19 
 
 
1341 aa  89  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  24.86 
 
 
1319 aa  88.6  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  26.96 
 
 
1290 aa  88.2  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  24.86 
 
 
1299 aa  86.7  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  25.3 
 
 
1184 aa  83.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  25.3 
 
 
1184 aa  83.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>