155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2532 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  100 
 
 		 1310 aa  2655    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  24.91 
 
 		 1299 aa  406  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1304 aa  400  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1297 aa  385  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1385 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  24.87 
 
 		 1305 aa  379  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1290 aa  378  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  24.33 
 
 		 1344 aa  373  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  24.33 
 
 		 1344 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  24.26 
 
 		 1344 aa  367  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  23.82 
 
 		 1319 aa  364  6e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1398 aa  363  1e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1341 aa  358  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1504  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1355 aa  354  8e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1402 aa  351  5e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1449 aa  350  9e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  25.04 
 
 		 1353 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1254 aa  317  9.999999999999999e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1259 aa  309  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1259 aa  309  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1259 aa  309  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1259 aa  308  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1259 aa  308  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  23.03 
 
 		 1258 aa  301  4e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1259 aa  300  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4860  hypothetical protein  22.9 
 
 		 1259 aa  300  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  23.06 
 
 		 1259 aa  299  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1259 aa  300  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1259 aa  299  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4700  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1259 aa  298  4e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1259 aa  298  4e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5739  hypothetical protein  22.91 
 
 		 1259 aa  298  5e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  22.18 
 
 		 1246 aa  296  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1265 aa  287  8e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  21.56 
 
 		 1249 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0460  hypothetical protein  22.36 
 
 		 1256 aa  286  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.524454  normal  0.757907 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  23.84 
 
 		 1342 aa  282  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1340 aa  282  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3769  hypothetical protein  21.9 
 
 		 1291 aa  281  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  22.57 
 
 		 1259 aa  280  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  22.3 
 
 		 1283 aa  280  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3963  hypothetical protein  23.19 
 
 		 1305 aa  278  7e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3624  hypothetical protein  23.52 
 
 		 1312 aa  277  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1290 aa  273  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  22.32 
 
 		 1254 aa  272  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  24.67 
 
 		 857 aa  253  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  21.85 
 
 		 1174 aa  243  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1319 aa  236  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1223 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1221 aa  219  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  25.06 
 
 		 1226 aa  218  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1221 aa  216  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0340  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1174 aa  213  1e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1224 aa  212  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  27.68 
 
 		 1224 aa  211  7e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1352 aa  210  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  27.68 
 
 		 1206 aa  210  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1229 aa  207  9e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1224 aa  205  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1914  hypothetical protein  20.61 
 
 		 1328 aa  191  5e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.131903  normal  0.0193441 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1226 aa  190  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1509  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1664 aa  186  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  25.26 
 
 		 1232 aa  186  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04025  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1302 aa  185  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1688  hypothetical protein  21.92 
 
 		 1664 aa  183  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  25 
 
 		 1255 aa  183  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1606  hypothetical protein  22.13 
 
 		 1773 aa  173  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0503817  hitchhiker  0.0000303134 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  22.29 
 
 		 1382 aa  173  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0607  hypothetical protein  22.76 
 
 		 982 aa  165  4.0000000000000004e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  21.08 
 
 		 1262 aa  156  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  25.47 
 
 		 1025 aa  145  5e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  23.4 
 
 		 1285 aa  137  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  22.74 
 
 		 1285 aa  125  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1770  hypothetical protein  22.22 
 
 		 846 aa  123  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1771  hypothetical protein  22.67 
 
 		 846 aa  120  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1308 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1401 aa  112  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1031  protein of unknown function DUF490  26.52 
 
 		 1426 aa  109  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1453 aa  108  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1218 aa  107  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  23.19 
 
 		 1273 aa  103  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  23.19 
 
 		 1273 aa  103  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1796  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1332 aa  102  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5769  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1360 aa  101  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0973726  normal  0.232191 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1434 aa  101  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2443  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1347 aa  99.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1827  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1347 aa  100  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2438  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1347 aa  100  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1346 aa  98.6  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1375 aa  97.8  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1372 aa  97.8  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1372 aa  97.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1372 aa  97.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1372 aa  97.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1372 aa  97.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1372 aa  97.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  25.58 
 
 		 1392 aa  96.3  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  23.87 
 
 		 1485 aa  96.3  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1256 aa  95.5  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1372 aa  95.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>