167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0447 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  37.1 
 
 		 1382 aa  671    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  100 
 
 		 1352 aa  2594    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  32.94 
 
 		 1262 aa  411  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  30.63 
 
 		 1224 aa  312  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  31.86 
 
 		 1223 aa  310  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3769  hypothetical protein  26.04 
 
 		 1291 aa  304  7.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  30.44 
 
 		 1224 aa  303  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  31.42 
 
 		 1283 aa  301  4e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  31.84 
 
 		 1221 aa  302  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  30.28 
 
 		 1229 aa  301  7e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  30.28 
 
 		 1226 aa  300  8e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3624  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1312 aa  301  8e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0460  hypothetical protein  29.56 
 
 		 1256 aa  301  8e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.524454  normal  0.757907 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3963  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1305 aa  300  9e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  26 
 
 		 1265 aa  300  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  32.44 
 
 		 1221 aa  299  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  31.91 
 
 		 1206 aa  298  6e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  31.63 
 
 		 1224 aa  296  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  31.06 
 
 		 1255 aa  295  4e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  28.3 
 
 		 1254 aa  295  5e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  34.01 
 
 		 1232 aa  293  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  29.32 
 
 		 1340 aa  287  8e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  26.44 
 
 		 1254 aa  286  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1259 aa  285  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  30.45 
 
 		 1249 aa  285  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1259 aa  285  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1259 aa  285  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1273 aa  285  5.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  29.01 
 
 		 1342 aa  284  8.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  28.81 
 
 		 1273 aa  284  8.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  28.08 
 
 		 1259 aa  284  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  31.45 
 
 		 1174 aa  284  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  28.2 
 
 		 1259 aa  283  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  30.5 
 
 		 1226 aa  281  7e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  27.76 
 
 		 1285 aa  281  8e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  25.22 
 
 		 1290 aa  279  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1344 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1344 aa  277  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  27.27 
 
 		 1344 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1259 aa  276  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  27.14 
 
 		 1259 aa  275  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4860  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1259 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1259 aa  275  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  27.74 
 
 		 1259 aa  275  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  27.74 
 
 		 857 aa  275  6e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  27.74 
 
 		 1259 aa  274  7e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4700  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1259 aa  274  8.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5739  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1259 aa  273  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1341 aa  272  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1258 aa  272  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  28.52 
 
 		 1285 aa  272  4e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  26.34 
 
 		 1305 aa  271  7e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  28.21 
 
 		 1025 aa  270  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  30.92 
 
 		 1319 aa  270  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  26.86 
 
 		 1259 aa  269  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  27.12 
 
 		 1246 aa  265  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1353 aa  253  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  24.57 
 
 		 1304 aa  248  6e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  25.17 
 
 		 1299 aa  239  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1297 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1402 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1290 aa  235  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1398 aa  235  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  26.52 
 
 		 1385 aa  234  7.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1449 aa  234  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  25.22 
 
 		 1319 aa  231  7e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  28.46 
 
 		 1243 aa  222  5e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1504  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1355 aa  221  7e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1914  hypothetical protein  22.93 
 
 		 1328 aa  215  3.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.131903  normal  0.0193441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1310 aa  211  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  28.62 
 
 		 1308 aa  207  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  31.4 
 
 		 1325 aa  205  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1688  hypothetical protein  27.77 
 
 		 1664 aa  202  5e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1509  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1664 aa  199  3e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1606  hypothetical protein  22.57 
 
 		 1773 aa  197  9e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0503817  hitchhiker  0.0000303134 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0340  hypothetical protein  23.4 
 
 		 1174 aa  197  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04025  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1302 aa  197  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  30.29 
 
 		 1485 aa  192  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  30.23 
 
 		 1485 aa  191  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1770  hypothetical protein  27.17 
 
 		 846 aa  189  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1771  hypothetical protein  27.36 
 
 		 846 aa  187  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1056 aa  181  9e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  28.98 
 
 		 1377 aa  177  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  25.74 
 
 		 1184 aa  176  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1184 aa  176  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0291  hypothetical protein  26.62 
 
 		 929 aa  171  7e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1899  hypothetical outer membrane protein  26.62 
 
 		 929 aa  171  7e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0551732  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1448 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  32.06 
 
 		 1443 aa  158  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  24.89 
 
 		 1392 aa  155  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  33.58 
 
 		 1453 aa  155  7e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  31.06 
 
 		 1359 aa  154  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1372 aa  154  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0852  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1375 aa  154  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  25.72 
 
 		 1372 aa  153  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1435 aa  153  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  25.72 
 
 		 1372 aa  153  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  25.72 
 
 		 1372 aa  153  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  25.72 
 
 		 1372 aa  153  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  31.9 
 
 		 1378 aa  152  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>