144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4860 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  98.81 
 
 		 1259 aa  2509    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  99.05 
 
 		 1259 aa  2514    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  99.3 
 
 		 857 aa  1721    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  85.94 
 
 		 1259 aa  2248    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  32.88 
 
 		 1265 aa  721    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  33.6 
 
 		 1254 aa  726    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  52.7 
 
 		 1246 aa  1307    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5739  hypothetical protein  98.97 
 
 		 1259 aa  2514    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  51.71 
 
 		 1249 aa  1316    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  85.86 
 
 		 1259 aa  2243    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  86.1 
 
 		 1259 aa  2250    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  83.96 
 
 		 1258 aa  2191    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  33.81 
 
 		 1254 aa  729    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  86.02 
 
 		 1259 aa  2247    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3624  hypothetical protein  62.02 
 
 		 1312 aa  1377    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  56.86 
 
 		 1340 aa  1494    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  33.98 
 
 		 1290 aa  743    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  99.05 
 
 		 1259 aa  2514    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  99.36 
 
 		 1259 aa  2521    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0460  hypothetical protein  63.59 
 
 		 1256 aa  1654    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.524454  normal  0.757907 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  85.86 
 
 		 1259 aa  2244    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  56.17 
 
 		 1342 aa  1454    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3963  hypothetical protein  57.55 
 
 		 1305 aa  1527    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3769  hypothetical protein  57.83 
 
 		 1291 aa  1540    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  98.81 
 
 		 1259 aa  2510    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4700  hypothetical protein  98.81 
 
 		 1259 aa  2507    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4860  hypothetical protein  100 
 
 		 1259 aa  2539    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  30.28 
 
 		 1319 aa  541  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0340  hypothetical protein  37.82 
 
 		 1174 aa  519  1.0000000000000001e-145  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0607  hypothetical protein  37 
 
 		 982 aa  503  1e-141  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  29.48 
 
 		 1283 aa  475  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  28.46 
 
 		 1259 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1914  hypothetical protein  23.91 
 
 		 1328 aa  429  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.131903  normal  0.0193441 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  27.22 
 
 		 1344 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1344 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  26.89 
 
 		 1344 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  25.43 
 
 		 1290 aa  422  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1341 aa  420  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  26.87 
 
 		 1305 aa  415  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1319 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  26.39 
 
 		 1299 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1304 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1206 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1224 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1385 aa  373  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  25.3 
 
 		 1353 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1297 aa  363  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  30.19 
 
 		 1224 aa  363  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1223 aa  360  7e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1224 aa  360  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1226 aa  356  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  24 
 
 		 1398 aa  355  4e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1221 aa  352  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1229 aa  350  9e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1221 aa  348  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1232 aa  348  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1174 aa  347  6e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1255 aa  338  2.9999999999999997e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  28.47 
 
 		 1226 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04025  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1302 aa  322  3e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1262 aa  321  6e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1504  hypothetical protein  25.3 
 
 		 1355 aa  319  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1449 aa  296  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  22.9 
 
 		 1310 aa  293  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  26.86 
 
 		 1402 aa  290  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1352 aa  275  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  27.05 
 
 		 1382 aa  266  3e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1688  hypothetical protein  23.49 
 
 		 1664 aa  262  4e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1606  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1773 aa  258  4e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0503817  hitchhiker  0.0000303134 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1509  hypothetical protein  23.25 
 
 		 1664 aa  254  7e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  24.92 
 
 		 1285 aa  204  6e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  25.44 
 
 		 1285 aa  204  6e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1273 aa  192  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  25 
 
 		 1273 aa  191  5.999999999999999e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  27.19 
 
 		 1308 aa  172  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  23.2 
 
 		 1025 aa  164  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1377 aa  148  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  24.28 
 
 		 1243 aa  142  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1325 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  23.85 
 
 		 1485 aa  132  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  23.06 
 
 		 1485 aa  118  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1453 aa  115  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1770  hypothetical protein  27.89 
 
 		 846 aa  112  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  27.27 
 
 		 1184 aa  112  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1184 aa  112  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1771  hypothetical protein  27.89 
 
 		 846 aa  110  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  23.4 
 
 		 1359 aa  107  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  25.74 
 
 		 1378 aa  105  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1796  hypothetical protein  33.46 
 
 		 1332 aa  102  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1448 aa  101  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1380 aa  98.6  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1056 aa  97.8  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  23.13 
 
 		 1443 aa  95.5  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1372 aa  95.1  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1372 aa  94.7  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1435 aa  94.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1372 aa  94  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1372 aa  94  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1372 aa  94  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1372 aa  94  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>