145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A4475 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04092  hypothetical protein  99.44 
 
 
1259 aa  2528    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0371692  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3771  protein of unknown function DUF490  99.21 
 
 
1259 aa  2522    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0789  protein of unknown function DUF490  53.02 
 
 
1246 aa  1319    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3415  hypothetical protein  57.32 
 
 
1340 aa  1507    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4775  hypothetical protein  86.18 
 
 
1259 aa  2255    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4809  hypothetical protein  86.1 
 
 
1259 aa  2252    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4690  hypothetical protein  86.26 
 
 
1259 aa  2256    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04056  hypothetical protein  99.88 
 
 
857 aa  1735    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0496889  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5739  hypothetical protein  99.29 
 
 
1259 aa  2523    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3574  protein of unknown function DUF490  62.75 
 
 
1342 aa  1365    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4830  hypothetical protein  86.1 
 
 
1259 aa  2252    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4679  hypothetical protein  86.34 
 
 
1259 aa  2258    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0399  hypothetical protein  84.11 
 
 
1258 aa  2200    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2125  hypothetical protein  34.05 
 
 
1254 aa  733    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0434  hypothetical protein  32.8 
 
 
1265 aa  717    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00651214  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3624  hypothetical protein  57.01 
 
 
1312 aa  1509    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0823  protein of unknown function DUF490  52.11 
 
 
1249 aa  1326    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11987  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00780  hypothetical protein  34.13 
 
 
1290 aa  746    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4475  hypothetical protein  100 
 
 
1259 aa  2536    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4791  hypothetical protein  99.52 
 
 
1259 aa  2527    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0460  hypothetical protein  63.83 
 
 
1256 aa  1662    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.524454  normal  0.757907 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001693  uncharacterized protein YtfN  33.76 
 
 
1254 aa  731    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3963  hypothetical protein  57.87 
 
 
1305 aa  1536    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3769  hypothetical protein  58.13 
 
 
1291 aa  1550    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3786  hypothetical protein  99.44 
 
 
1259 aa  2528    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.88855  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4700  hypothetical protein  98.97 
 
 
1259 aa  2513    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4860  hypothetical protein  99.05 
 
 
1259 aa  2514    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1864  hypothetical protein  30.28 
 
 
1319 aa  544  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0340  hypothetical protein  37.82 
 
 
1174 aa  519  1.0000000000000001e-145  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0607  hypothetical protein  37.43 
 
 
982 aa  513  1e-143  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0534  hypothetical protein  29.7 
 
 
1283 aa  482  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0817453  normal  0.113617 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0261  hypothetical protein  28.88 
 
 
1259 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1914  hypothetical protein  24.14 
 
 
1328 aa  432  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.131903  normal  0.0193441 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  26.82 
 
 
1344 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  26.78 
 
 
1344 aa  432  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  26.89 
 
 
1341 aa  430  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  26.22 
 
 
1290 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  26.71 
 
 
1344 aa  430  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  27.25 
 
 
1305 aa  422  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2511  hypothetical protein  25.49 
 
 
1319 aa  406  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0732118  normal  0.936586 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  26.24 
 
 
1299 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  25.56 
 
 
1304 aa  399  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  26.22 
 
 
1385 aa  383  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  27.09 
 
 
1224 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  27.12 
 
 
1206 aa  377  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  25.44 
 
 
1353 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  26.12 
 
 
1297 aa  369  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  30.16 
 
 
1224 aa  366  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  28.45 
 
 
1223 aa  366  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  27.41 
 
 
1224 aa  365  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  24.29 
 
 
1398 aa  361  4e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  25.9 
 
 
1221 aa  360  8e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  26.06 
 
 
1221 aa  357  7.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  25.85 
 
 
1226 aa  357  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  28.9 
 
 
1229 aa  351  5e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  28.03 
 
 
1232 aa  350  8e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1968  hypothetical protein  26.78 
 
 
1174 aa  343  9e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2011  hypothetical protein  29.16 
 
 
1255 aa  343  1e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.592581  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2433  hypothetical protein  26.32 
 
 
1226 aa  341  5e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.751068 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04025  hypothetical protein  25.35 
 
 
1302 aa  328  5e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0371  hypothetical protein  23.93 
 
 
1262 aa  322  3e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1504  hypothetical protein  25.26 
 
 
1355 aa  321  6e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  27.23 
 
 
1449 aa  300  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  27.44 
 
 
1402 aa  295  4e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2532  hypothetical protein  23.06 
 
 
1310 aa  293  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  27.09 
 
 
1352 aa  275  4.0000000000000004e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  27.28 
 
 
1382 aa  274  8.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1606  hypothetical protein  23.39 
 
 
1773 aa  263  2e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0503817  hitchhiker  0.0000303134 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1688  hypothetical protein  23.3 
 
 
1664 aa  258  7e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1509  hypothetical protein  23.16 
 
 
1664 aa  253  1e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3980  protein of unknown function DUF490  25.14 
 
 
1285 aa  206  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.556026 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03725  pathogenicity protein  25.39 
 
 
1285 aa  204  7e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0505  hypothetical protein  25.13 
 
 
1273 aa  196  3e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0569  pathogenicity protein  25.21 
 
 
1273 aa  195  5e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  27.19 
 
 
1308 aa  171  8e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1750  protein of unknown function DUF490  23.14 
 
 
1025 aa  167  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  25.66 
 
 
1377 aa  147  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  24.66 
 
 
1325 aa  144  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  24.34 
 
 
1243 aa  142  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3175  protein of unknown function DUF490  24.01 
 
 
1485 aa  129  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1088  protein of unknown function DUF490  22.6 
 
 
1485 aa  119  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000343401 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  27.09 
 
 
1453 aa  116  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1770  hypothetical protein  27.89 
 
 
846 aa  112  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1957  hypothetical protein  27.27 
 
 
1184 aa  112  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1625  protein of unknown function DUF490  27.27 
 
 
1184 aa  112  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031551 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1771  hypothetical protein  27.89 
 
 
846 aa  109  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  23.4 
 
 
1359 aa  107  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  25.74 
 
 
1378 aa  106  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2193  hypothetical protein  23.91 
 
 
1448 aa  102  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805579  normal  0.538976 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1796  hypothetical protein  33.46 
 
 
1332 aa  102  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  25.32 
 
 
1380 aa  100  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  23.26 
 
 
1443 aa  99.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2771  hypothetical protein  23.52 
 
 
1392 aa  99.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105544  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3484  hypothetical protein  23.6 
 
 
1435 aa  99  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00155309  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  23.45 
 
 
1372 aa  96.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  23.51 
 
 
1056 aa  97.1  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1048  hypothetical protein  23.45 
 
 
1372 aa  97.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.130543  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  23.45 
 
 
1372 aa  95.9  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  23.45 
 
 
1372 aa  95.9  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  23.45 
 
 
1372 aa  95.9  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>